Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BcrQ6PAJ1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BcrQ6PAJ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BcrQ6PAJ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BcrQ6PAJ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BcrQ6PAJ1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BcrQ6PAJ1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BcrQ6PAJ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BcrQ6PAJ1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BcrQ6PAJ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BcrQ6PAJ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BcrQ6PAJ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BcrQ6PAJ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BcrQ6PAJ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BcrQ6PAJ1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BcrQ6PAJ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BcrQ6PAJ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BcrQ6PAJ1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BcrQ6PAJ1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BcrQ6PAJ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BcrQ6PAJ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BcrQ6PAJ1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BcrQ6PAJ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BcrQ6PAJ1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BcrQ6PAJ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BcrQ6PAJ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BcrQ6PAJ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BcrQ6PAJ1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BcrQ6PAJ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BcrQ6PAJ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BcrQ6PAJ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BcrQ6PAJ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BcrQ6PAJ1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BcrQ6PAJ1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BcrQ6PAJ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BcrQ6PAJ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BcrQ6PAJ1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BcrQ6PAJ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BcrQ6PAJ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BcrQ6PAJ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BcrQ6PAJ1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BcrQ6PAJ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BcrQ6PAJ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BcrQ6PAJ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BcrQ6PAJ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BcrQ6PAJ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BcrQ6PAJ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BcrQ6PAJ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BcrQ6PAJ1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BcrQ6PAJ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BcrQ6PAJ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BcrQ6PAJ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BcrQ6PAJ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BcrQ6PAJ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BcrQ6PAJ1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BcrQ6PAJ1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BcrQ6PAJ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BcrQ6PAJ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BcrQ6PAJ1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BcrQ6PAJ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BcrQ6PAJ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BcrQ6PAJ1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BcrQ6PAJ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BcrQ6PAJ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BcrQ6PAJ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BcrQ6PAJ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BcrQ6PAJ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms