Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gga2Q6P5E6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gga2Q6P5E6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gga2Q6P5E6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gga2Q6P5E6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gga2Q6P5E6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gga2Q6P5E6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gga2Q6P5E6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gga2Q6P5E6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gga2Q6P5E6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gga2Q6P5E6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gga2Q6P5E6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gga2Q6P5E6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gga2Q6P5E6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gga2Q6P5E6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gga2Q6P5E6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gga2Q6P5E6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gga2Q6P5E6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gga2Q6P5E6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gga2Q6P5E6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gga2Q6P5E6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gga2Q6P5E6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gga2Q6P5E6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gga2Q6P5E6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gga2Q6P5E6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gga2Q6P5E6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gga2Q6P5E6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gga2Q6P5E6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gga2Q6P5E6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gga2Q6P5E6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gga2Q6P5E6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gga2Q6P5E6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gga2Q6P5E6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gga2Q6P5E6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gga2Q6P5E6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gga2Q6P5E6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gga2Q6P5E6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga2Q6P5E6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga2Q6P5E6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga2Q6P5E6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gga2Q6P5E6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gga2Q6P5E6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gga2Q6P5E6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gga2Q6P5E6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gga2Q6P5E6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gga2Q6P5E6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gga2Q6P5E6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gga2Q6P5E6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gga2Q6P5E6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gga2Q6P5E6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gga2Q6P5E6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gga2Q6P5E6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gga2Q6P5E6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gga2Q6P5E6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gga2Q6P5E6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gga2Q6P5E6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gga2Q6P5E6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gga2Q6P5E6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga2Q6P5E6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga2Q6P5E6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga2Q6P5E6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga2Q6P5E6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga2Q6P5E6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga2Q6P5E6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gga2Q6P5E6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gga2Q6P5E6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gga2Q6P5E6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gga2Q6P5E6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gga2Q6P5E6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gga2Q6P5E6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gga2Q6P5E6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gga2Q6P5E6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gga2Q6P5E6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gga2Q6P5E6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gga2Q6P5E6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gga2Q6P5E6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gga2Q6P5E6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gga2Q6P5E6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gga2Q6P5E6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gga2Q6P5E6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gga2Q6P5E6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms