Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF6

Git1, ARF GTPase-activating protein GIT1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Git1Q68FF6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Git1Q68FF6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Git1Q68FF6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Git1Q68FF6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Git1Q68FF6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Git1Q68FF6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Git1Q68FF6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Git1Q68FF6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Git1Q68FF6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Git1Q68FF6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Git1Q68FF6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Git1Q68FF6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Git1Q68FF6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Git1Q68FF6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Git1Q68FF6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Git1Q68FF6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Git1Q68FF6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Git1Q68FF6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Git1Q68FF6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Git1Q68FF6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Git1Q68FF6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Git1Q68FF6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Git1Q68FF6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Git1Q68FF6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Git1Q68FF6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Git1Q68FF6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Git1Q68FF6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Git1Q68FF6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Git1Q68FF6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Git1Q68FF6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Git1Q68FF6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Git1Q68FF6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Git1Q68FF6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Git1Q68FF6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Git1Q68FF6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Git1Q68FF6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Git1Q68FF6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Git1Q68FF6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Git1Q68FF6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Git1Q68FF6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Git1Q68FF6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Git1Q68FF6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Git1Q68FF6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Git1Q68FF6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Git1Q68FF6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Git1Q68FF6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Git1Q68FF6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Git1Q68FF6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Git1Q68FF6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Git1Q68FF6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Git1Q68FF6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Git1Q68FF6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Git1Q68FF6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Git1Q68FF6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Git1Q68FF6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Git1Q68FF6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Git1Q68FF6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Git1Q68FF6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Git1Q68FF6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Git1Q68FF6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Git1Q68FF6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Git1Q68FF6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Git1Q68FF6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Git1Q68FF6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Git1Q68FF6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Git1Q68FF6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Git1Q68FF6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Git1Q68FF6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Git1Q68FF6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Git1Q68FF6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Git1Q68FF6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Git1Q68FF6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Git1Q68FF6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Git1Q68FF6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Git1Q68FF6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Git1Q68FF6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Git1Q68FF6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Git1Q68FF6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Git1Q68FF6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Git1Q68FF6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Git1Q68FF6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Git1Q68FF6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Git1Q68FF6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Git1Q68FF6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Git1Q68FF6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Git1Q68FF6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Git1Q68FF6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Git1Q68FF6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Git1Q68FF6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Git1Q68FF6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Git1Q68FF6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Git1Q68FF6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Git1Q68FF6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Git1Q68FF6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Git1Q68FF6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Git1Q68FF6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Git1Q68FF6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Git1Q68FF6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Git1Q68FF6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Git1Q68FF6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms