Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ift52Q62559 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift52Q62559 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift52Q62559 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift52Q62559 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift52Q62559 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift52Q62559 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift52Q62559 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift52Q62559 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift52Q62559 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift52Q62559 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift52Q62559 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift52Q62559 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift52Q62559 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift52Q62559 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift52Q62559 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift52Q62559 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift52Q62559 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift52Q62559 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift52Q62559 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ift52Q62559 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ift52Q62559 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ift52Q62559 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift52Q62559 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift52Q62559 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift52Q62559 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift52Q62559 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift52Q62559 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift52Q62559 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift52Q62559 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift52Q62559 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift52Q62559 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift52Q62559 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift52Q62559 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift52Q62559 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ift52Q62559 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift52Q62559 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift52Q62559 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift52Q62559 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift52Q62559 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift52Q62559 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift52Q62559 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift52Q62559 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift52Q62559 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift52Q62559 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift52Q62559 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift52Q62559 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift52Q62559 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift52Q62559 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift52Q62559 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift52Q62559 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift52Q62559 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift52Q62559 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift52Q62559 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift52Q62559 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift52Q62559 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift52Q62559 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift52Q62559 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift52Q62559 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift52Q62559 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift52Q62559 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift52Q62559 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift52Q62559 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift52Q62559 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift52Q62559 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift52Q62559 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift52Q62559 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift52Q62559 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift52Q62559 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift52Q62559 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift52Q62559 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift52Q62559 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift52Q62559 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift52Q62559 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift52Q62559 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift52Q62559 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift52Q62559 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift52Q62559 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift52Q62559 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ift52Q62559 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.6 ms