Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema4aQ62178 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema4aQ62178 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema4aQ62178 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema4aQ62178 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema4aQ62178 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema4aQ62178 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema4aQ62178 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4aQ62178 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema4aQ62178 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema4aQ62178 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema4aQ62178 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema4aQ62178 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema4aQ62178 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema4aQ62178 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema4aQ62178 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema4aQ62178 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema4aQ62178 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema4aQ62178 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema4aQ62178 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema4aQ62178 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema4aQ62178 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema4aQ62178 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema4aQ62178 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema4aQ62178 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema4aQ62178 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema4aQ62178 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema4aQ62178 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema4aQ62178 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema4aQ62178 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema4aQ62178 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema4aQ62178 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4aQ62178 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4aQ62178 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4aQ62178 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema4aQ62178 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema4aQ62178 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema4aQ62178 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema4aQ62178 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema4aQ62178 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema4aQ62178 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema4aQ62178 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema4aQ62178 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema4aQ62178 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema4aQ62178 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema4aQ62178 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema4aQ62178 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema4aQ62178 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema4aQ62178 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema4aQ62178 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema4aQ62178 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema4aQ62178 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema4aQ62178 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema4aQ62178 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4aQ62178 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sema4aQ62178 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema4aQ62178 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema4aQ62178 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema4aQ62178 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema4aQ62178 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema4aQ62178 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema4aQ62178 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema4aQ62178 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sema4aQ62178 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema4aQ62178 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema4aQ62178 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema4aQ62178 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema4aQ62178 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema4aQ62178 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema4aQ62178 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sema4aQ62178 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sema4aQ62178 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema4aQ62178 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema4aQ62178 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema4aQ62178 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema4aQ62178 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema4aQ62178 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema4aQ62178 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema4aQ62178 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema4aQ62178 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms