Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prm3Q62100 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prm3Q62100 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prm3Q62100 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prm3Q62100 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prm3Q62100 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prm3Q62100 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prm3Q62100 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prm3Q62100 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prm3Q62100 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prm3Q62100 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prm3Q62100 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prm3Q62100 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prm3Q62100 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prm3Q62100 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prm3Q62100 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prm3Q62100 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Prm3Q62100 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prm3Q62100 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prm3Q62100 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prm3Q62100 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prm3Q62100 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prm3Q62100 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prm3Q62100 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prm3Q62100 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prm3Q62100 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Prm3Q62100 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prm3Q62100 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prm3Q62100 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prm3Q62100 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prm3Q62100 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prm3Q62100 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prm3Q62100 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Prm3Q62100 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prm3Q62100 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prm3Q62100 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prm3Q62100 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prm3Q62100 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prm3Q62100 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prm3Q62100 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prm3Q62100 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prm3Q62100 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prm3Q62100 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prm3Q62100 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prm3Q62100 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prm3Q62100 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Prm3Q62100 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prm3Q62100 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prm3Q62100 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prm3Q62100 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prm3Q62100 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prm3Q62100 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prm3Q62100 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prm3Q62100 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prm3Q62100 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prm3Q62100 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prm3Q62100 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prm3Q62100 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prm3Q62100 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prm3Q62100 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prm3Q62100 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prm3Q62100 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prm3Q62100 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prm3Q62100 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prm3Q62100 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prm3Q62100 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prm3Q62100 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prm3Q62100 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prm3Q62100 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prm3Q62100 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prm3Q62100 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prm3Q62100 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prm3Q62100 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prm3Q62100 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prm3Q62100 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prm3Q62100 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prm3Q62100 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prm3Q62100 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prm3Q62100 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prm3Q62100 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms