Protein–RNA interactions for Protein: Q61137

Astn1, Astrotactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Astn1Q61137 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Astn1Q61137 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Astn1Q61137 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Astn1Q61137 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Astn1Q61137 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Astn1Q61137 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Astn1Q61137 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Astn1Q61137 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Astn1Q61137 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Astn1Q61137 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Astn1Q61137 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Astn1Q61137 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Astn1Q61137 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Astn1Q61137 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Astn1Q61137 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Astn1Q61137 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Astn1Q61137 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Astn1Q61137 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Astn1Q61137 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Astn1Q61137 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Astn1Q61137 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Astn1Q61137 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Astn1Q61137 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Astn1Q61137 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Astn1Q61137 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Astn1Q61137 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Astn1Q61137 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Astn1Q61137 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Astn1Q61137 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Astn1Q61137 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Astn1Q61137 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Astn1Q61137 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Astn1Q61137 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Astn1Q61137 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Astn1Q61137 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Astn1Q61137 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Astn1Q61137 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Astn1Q61137 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Astn1Q61137 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Astn1Q61137 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Astn1Q61137 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Astn1Q61137 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Astn1Q61137 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Astn1Q61137 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Astn1Q61137 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Astn1Q61137 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Astn1Q61137 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Astn1Q61137 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Astn1Q61137 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Astn1Q61137 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Astn1Q61137 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Astn1Q61137 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Astn1Q61137 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Astn1Q61137 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Astn1Q61137 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Astn1Q61137 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Astn1Q61137 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Astn1Q61137 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Astn1Q61137 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Astn1Q61137 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Astn1Q61137 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Astn1Q61137 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Astn1Q61137 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Astn1Q61137 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Astn1Q61137 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Astn1Q61137 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Astn1Q61137 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Astn1Q61137 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Astn1Q61137 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Astn1Q61137 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Astn1Q61137 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Astn1Q61137 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Astn1Q61137 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Astn1Q61137 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Astn1Q61137 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Astn1Q61137 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Astn1Q61137 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Astn1Q61137 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Astn1Q61137 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Astn1Q61137 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Astn1Q61137 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Astn1Q61137 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Astn1Q61137 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Astn1Q61137 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Astn1Q61137 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Astn1Q61137 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Astn1Q61137 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Astn1Q61137 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Astn1Q61137 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Astn1Q61137 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Astn1Q61137 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Astn1Q61137 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Astn1Q61137 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Astn1Q61137 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Astn1Q61137 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Astn1Q61137 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Astn1Q61137 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Astn1Q61137 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Astn1Q61137 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Astn1Q61137 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms