Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PkdccQ5RJI4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PkdccQ5RJI4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PkdccQ5RJI4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PkdccQ5RJI4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PkdccQ5RJI4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PkdccQ5RJI4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PkdccQ5RJI4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PkdccQ5RJI4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PkdccQ5RJI4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PkdccQ5RJI4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PkdccQ5RJI4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PkdccQ5RJI4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PkdccQ5RJI4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PkdccQ5RJI4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PkdccQ5RJI4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PkdccQ5RJI4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PkdccQ5RJI4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PkdccQ5RJI4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PkdccQ5RJI4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PkdccQ5RJI4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PkdccQ5RJI4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PkdccQ5RJI4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PkdccQ5RJI4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PkdccQ5RJI4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PkdccQ5RJI4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PkdccQ5RJI4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PkdccQ5RJI4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PkdccQ5RJI4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PkdccQ5RJI4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PkdccQ5RJI4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PkdccQ5RJI4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PkdccQ5RJI4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PkdccQ5RJI4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PkdccQ5RJI4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PkdccQ5RJI4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PkdccQ5RJI4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PkdccQ5RJI4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PkdccQ5RJI4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PkdccQ5RJI4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PkdccQ5RJI4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PkdccQ5RJI4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PkdccQ5RJI4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PkdccQ5RJI4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PkdccQ5RJI4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PkdccQ5RJI4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PkdccQ5RJI4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PkdccQ5RJI4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PkdccQ5RJI4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PkdccQ5RJI4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PkdccQ5RJI4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PkdccQ5RJI4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PkdccQ5RJI4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PkdccQ5RJI4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PkdccQ5RJI4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PkdccQ5RJI4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PkdccQ5RJI4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PkdccQ5RJI4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PkdccQ5RJI4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PkdccQ5RJI4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PkdccQ5RJI4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PkdccQ5RJI4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PkdccQ5RJI4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PkdccQ5RJI4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PkdccQ5RJI4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PkdccQ5RJI4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PkdccQ5RJI4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PkdccQ5RJI4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PkdccQ5RJI4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PkdccQ5RJI4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PkdccQ5RJI4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PkdccQ5RJI4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PkdccQ5RJI4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PkdccQ5RJI4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PkdccQ5RJI4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PkdccQ5RJI4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PkdccQ5RJI4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PkdccQ5RJI4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PkdccQ5RJI4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PkdccQ5RJI4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PkdccQ5RJI4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PkdccQ5RJI4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PkdccQ5RJI4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PkdccQ5RJI4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PkdccQ5RJI4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PkdccQ5RJI4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PkdccQ5RJI4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PkdccQ5RJI4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PkdccQ5RJI4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PkdccQ5RJI4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PkdccQ5RJI4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PkdccQ5RJI4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.4 ms