Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srbd1Q497V5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srbd1Q497V5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srbd1Q497V5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srbd1Q497V5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srbd1Q497V5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Srbd1Q497V5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srbd1Q497V5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srbd1Q497V5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srbd1Q497V5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srbd1Q497V5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srbd1Q497V5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srbd1Q497V5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srbd1Q497V5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srbd1Q497V5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Srbd1Q497V5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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