Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc185Q3V118 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc185Q3V118 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc185Q3V118 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc185Q3V118 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc185Q3V118 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc185Q3V118 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc185Q3V118 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc185Q3V118 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc185Q3V118 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc185Q3V118 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc185Q3V118 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc185Q3V118 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc185Q3V118 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc185Q3V118 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc185Q3V118 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc185Q3V118 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc185Q3V118 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc185Q3V118 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc185Q3V118 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc185Q3V118 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc185Q3V118 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc185Q3V118 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc185Q3V118 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc185Q3V118 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc185Q3V118 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc185Q3V118 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc185Q3V118 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc185Q3V118 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc185Q3V118 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc185Q3V118 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc185Q3V118 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc185Q3V118 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc185Q3V118 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc185Q3V118 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc185Q3V118 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc185Q3V118 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc185Q3V118 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc185Q3V118 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc185Q3V118 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc185Q3V118 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc185Q3V118 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc185Q3V118 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc185Q3V118 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc185Q3V118 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc185Q3V118 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc185Q3V118 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc185Q3V118 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc185Q3V118 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc185Q3V118 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc185Q3V118 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc185Q3V118 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc185Q3V118 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc185Q3V118 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc185Q3V118 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc185Q3V118 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc185Q3V118 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc185Q3V118 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc185Q3V118 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc185Q3V118 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc185Q3V118 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc185Q3V118 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc185Q3V118 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc185Q3V118 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc185Q3V118 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc185Q3V118 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc185Q3V118 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc185Q3V118 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc185Q3V118 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc185Q3V118 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc185Q3V118 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc185Q3V118 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc185Q3V118 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc185Q3V118 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc185Q3V118 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc185Q3V118 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc185Q3V118 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc185Q3V118 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc185Q3V118 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc185Q3V118 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc185Q3V118 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc185Q3V118 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc185Q3V118 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc185Q3V118 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc185Q3V118 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc185Q3V118 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc185Q3V118 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc185Q3V118 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc185Q3V118 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc185Q3V118 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc185Q3V118 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc185Q3V118 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc185Q3V118 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc185Q3V118 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc185Q3V118 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc185Q3V118 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc185Q3V118 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc185Q3V118 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc185Q3V118 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc185Q3V118 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms