Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tmed8Q3UHI4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tmed8Q3UHI4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmed8Q3UHI4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmed8Q3UHI4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmed8Q3UHI4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmed8Q3UHI4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmed8Q3UHI4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Tmed8Q3UHI4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tmed8Q3UHI4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tmed8Q3UHI4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tmed8Q3UHI4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tmed8Q3UHI4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmed8Q3UHI4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmed8Q3UHI4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmed8Q3UHI4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tmed8Q3UHI4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tmed8Q3UHI4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tmed8Q3UHI4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Tmed8Q3UHI4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tmed8Q3UHI4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tmed8Q3UHI4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tmed8Q3UHI4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tmed8Q3UHI4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Tmed8Q3UHI4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tmed8Q3UHI4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tmed8Q3UHI4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmed8Q3UHI4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tmed8Q3UHI4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tmed8Q3UHI4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tmed8Q3UHI4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tmed8Q3UHI4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tmed8Q3UHI4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tmed8Q3UHI4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tmed8Q3UHI4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Tmed8Q3UHI4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tmed8Q3UHI4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tmed8Q3UHI4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tmed8Q3UHI4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tmed8Q3UHI4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tmed8Q3UHI4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tmed8Q3UHI4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tmed8Q3UHI4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tmed8Q3UHI4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tmed8Q3UHI4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tmed8Q3UHI4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tmed8Q3UHI4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tmed8Q3UHI4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tmed8Q3UHI4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tmed8Q3UHI4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tmed8Q3UHI4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tmed8Q3UHI4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tmed8Q3UHI4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tmed8Q3UHI4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tmed8Q3UHI4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tmed8Q3UHI4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tmed8Q3UHI4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Tmed8Q3UHI4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tmed8Q3UHI4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tmed8Q3UHI4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tmed8Q3UHI4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tmed8Q3UHI4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tmed8Q3UHI4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tmed8Q3UHI4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tmed8Q3UHI4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Tmed8Q3UHI4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tmed8Q3UHI4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tmed8Q3UHI4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tmed8Q3UHI4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmed8Q3UHI4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmed8Q3UHI4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmed8Q3UHI4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmed8Q3UHI4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmed8Q3UHI4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmed8Q3UHI4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmed8Q3UHI4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmed8Q3UHI4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmed8Q3UHI4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tmed8Q3UHI4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tmed8Q3UHI4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tmed8Q3UHI4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tmed8Q3UHI4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tmed8Q3UHI4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tmed8Q3UHI4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tmed8Q3UHI4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Tmed8Q3UHI4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Tmed8Q3UHI4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tmed8Q3UHI4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tmed8Q3UHI4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tmed8Q3UHI4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Tmed8Q3UHI4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tmed8Q3UHI4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tmed8Q3UHI4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmed8Q3UHI4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmed8Q3UHI4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmed8Q3UHI4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Tmed8Q3UHI4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Tmed8Q3UHI4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tmed8Q3UHI4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tmed8Q3UHI4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms