Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdpgp1Q3TLS3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdpgp1Q3TLS3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdpgp1Q3TLS3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdpgp1Q3TLS3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdpgp1Q3TLS3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdpgp1Q3TLS3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdpgp1Q3TLS3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdpgp1Q3TLS3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdpgp1Q3TLS3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdpgp1Q3TLS3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdpgp1Q3TLS3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdpgp1Q3TLS3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdpgp1Q3TLS3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdpgp1Q3TLS3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gdpgp1Q3TLS3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdpgp1Q3TLS3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdpgp1Q3TLS3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdpgp1Q3TLS3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdpgp1Q3TLS3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdpgp1Q3TLS3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdpgp1Q3TLS3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdpgp1Q3TLS3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdpgp1Q3TLS3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpgp1Q3TLS3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpgp1Q3TLS3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpgp1Q3TLS3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdpgp1Q3TLS3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdpgp1Q3TLS3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdpgp1Q3TLS3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdpgp1Q3TLS3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdpgp1Q3TLS3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdpgp1Q3TLS3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gdpgp1Q3TLS3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdpgp1Q3TLS3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gdpgp1Q3TLS3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdpgp1Q3TLS3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdpgp1Q3TLS3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdpgp1Q3TLS3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdpgp1Q3TLS3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdpgp1Q3TLS3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdpgp1Q3TLS3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdpgp1Q3TLS3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdpgp1Q3TLS3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdpgp1Q3TLS3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdpgp1Q3TLS3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdpgp1Q3TLS3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdpgp1Q3TLS3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdpgp1Q3TLS3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdpgp1Q3TLS3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdpgp1Q3TLS3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gdpgp1Q3TLS3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdpgp1Q3TLS3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gdpgp1Q3TLS3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdpgp1Q3TLS3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdpgp1Q3TLS3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdpgp1Q3TLS3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdpgp1Q3TLS3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdpgp1Q3TLS3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdpgp1Q3TLS3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdpgp1Q3TLS3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdpgp1Q3TLS3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms