Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rpusd2Q149F1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rpusd2Q149F1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Rpusd2Q149F1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rpusd2Q149F1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rpusd2Q149F1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rpusd2Q149F1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rpusd2Q149F1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rpusd2Q149F1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rpusd2Q149F1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rpusd2Q149F1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rpusd2Q149F1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rpusd2Q149F1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rpusd2Q149F1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rpusd2Q149F1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rpusd2Q149F1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rpusd2Q149F1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rpusd2Q149F1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rpusd2Q149F1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Rpusd2Q149F1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rpusd2Q149F1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rpusd2Q149F1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rpusd2Q149F1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rpusd2Q149F1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rpusd2Q149F1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rpusd2Q149F1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rpusd2Q149F1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpusd2Q149F1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpusd2Q149F1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpusd2Q149F1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpusd2Q149F1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rpusd2Q149F1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpusd2Q149F1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpusd2Q149F1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rpusd2Q149F1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpusd2Q149F1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rpusd2Q149F1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rpusd2Q149F1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rpusd2Q149F1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpusd2Q149F1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpusd2Q149F1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpusd2Q149F1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rpusd2Q149F1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpusd2Q149F1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpusd2Q149F1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpusd2Q149F1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rpusd2Q149F1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpusd2Q149F1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpusd2Q149F1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpusd2Q149F1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rpusd2Q149F1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpusd2Q149F1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpusd2Q149F1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rpusd2Q149F1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rpusd2Q149F1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rpusd2Q149F1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rpusd2Q149F1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rpusd2Q149F1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rpusd2Q149F1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rpusd2Q149F1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rpusd2Q149F1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rpusd2Q149F1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rpusd2Q149F1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rpusd2Q149F1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rpusd2Q149F1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rpusd2Q149F1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Rpusd2Q149F1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rpusd2Q149F1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rpusd2Q149F1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rpusd2Q149F1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rpusd2Q149F1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rpusd2Q149F1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rpusd2Q149F1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rpusd2Q149F1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Rpusd2Q149F1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rpusd2Q149F1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rpusd2Q149F1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rpusd2Q149F1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rpusd2Q149F1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rpusd2Q149F1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rpusd2Q149F1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rpusd2Q149F1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rpusd2Q149F1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rpusd2Q149F1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rpusd2Q149F1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rpusd2Q149F1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rpusd2Q149F1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rpusd2Q149F1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rpusd2Q149F1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rpusd2Q149F1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rpusd2Q149F1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rpusd2Q149F1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpusd2Q149F1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rpusd2Q149F1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rpusd2Q149F1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rpusd2Q149F1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rpusd2Q149F1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rpusd2Q149F1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rpusd2Q149F1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Rpusd2Q149F1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
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