Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL4A6Q14031 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL4A6Q14031 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL4A6Q14031 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL4A6Q14031 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL4A6Q14031 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
COL4A6Q14031 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
COL4A6Q14031 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL4A6Q14031 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL4A6Q14031 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL4A6Q14031 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL4A6Q14031 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL4A6Q14031 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL4A6Q14031 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL4A6Q14031 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL4A6Q14031 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL4A6Q14031 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL4A6Q14031 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL4A6Q14031 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL4A6Q14031 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL4A6Q14031 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL4A6Q14031 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL4A6Q14031 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL4A6Q14031 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL4A6Q14031 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL4A6Q14031 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL4A6Q14031 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL4A6Q14031 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL4A6Q14031 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL4A6Q14031 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
COL4A6Q14031 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
COL4A6Q14031 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
COL4A6Q14031 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL4A6Q14031 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL4A6Q14031 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL4A6Q14031 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL4A6Q14031 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL4A6Q14031 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL4A6Q14031 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL4A6Q14031 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COL4A6Q14031 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COL4A6Q14031 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
COL4A6Q14031 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COL4A6Q14031 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
COL4A6Q14031 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COL4A6Q14031 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COL4A6Q14031 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COL4A6Q14031 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COL4A6Q14031 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COL4A6Q14031 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL4A6Q14031 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL4A6Q14031 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL4A6Q14031 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL4A6Q14031 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL4A6Q14031 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL4A6Q14031 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL4A6Q14031 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL4A6Q14031 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
COL4A6Q14031 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL4A6Q14031 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL4A6Q14031 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL4A6Q14031 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL4A6Q14031 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL4A6Q14031 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL4A6Q14031 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL4A6Q14031 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
COL4A6Q14031 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL4A6Q14031 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL4A6Q14031 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL4A6Q14031 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
COL4A6Q14031 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL4A6Q14031 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL4A6Q14031 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL4A6Q14031 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
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