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Protein–RNA interactions for Protein: Q12090
REX3, RNA exonuclease 3, yeast
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404 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
REX3
Q12090
MHF1
YOL086W-A
273 nt
8.19
□□□□□ -1.1
REX3
Q12090
ADE2
YOR128C
1716 nt
8.19
□□□□□ -1.1
REX3
Q12090
FMS1
YMR020W
1527 nt
8.19
□□□□□ -1.1
REX3
Q12090
FLR1
YBR008C
1647 nt
8.18
□□□□□ -1.1
REX3
Q12090
SOL2
YCR073W-A
948 nt
8.18
□□□□□ -1.1
REX3
Q12090
GSF2
YML048W
1212 nt
8.17
□□□□□ -1.1
REX3
Q12090
YMR262W
YMR262W
942 nt
8.17
□□□□□ -1.1
REX3
Q12090
ALD5
YER073W
1563 nt
8.17
□□□□□ -1.1
REX3
Q12090
THI6
YPL214C
1623 nt
8.17
□□□□□ -1.1
REX3
Q12090
RTG2
YGL252C
1767 nt
8.17
□□□□□ -1.1
REX3
Q12090
MUP1
YGR055W
1725 nt
8.16
□□□□□ -1.1
REX3
Q12090
ALR1
YOL130W
2580 nt
8.16
□□□□□ -1.1
REX3
Q12090
PGC1
YPL206C
966 nt
8.16
□□□□□ -1.1
REX3
Q12090
SSL2
YIL143C
2532 nt
8.15
□□□□□ -1.1
REX3
Q12090
DAK2
YFL053W
1776 nt
8.15
□□□□□ -1.1
REX3
Q12090
CTI6
YPL181W
1521 nt
8.15
□□□□□ -1.1
REX3
Q12090
YDL086W
YDL086W
822 nt
8.15
□□□□□ -1.1
REX3
Q12090
TMA23
YMR269W
636 nt
8.14
□□□□□ -1.11
REX3
Q12090
YPR126C
YPR126C
309 nt
8.14
□□□□□ -1.11
REX3
Q12090
PAR32
YDL173W
888 nt
8.13
□□□□□ -1.11
REX3
Q12090
DDI1
YER143W
1287 nt
8.13
□□□□□ -1.11
REX3
Q12090
ASP3-1
YLR155C
1089 nt
8.13
□□□□□ -1.11
REX3
Q12090
ASP3-2
YLR157C
1089 nt
8.13
□□□□□ -1.11
REX3
Q12090
ASP3-3
YLR158C
1089 nt
8.13
□□□□□ -1.11
REX3
Q12090
ASP3-4
YLR160C
1089 nt
8.13
□□□□□ -1.11
REX3
Q12090
SNZ1
YMR096W
894 nt
8.13
□□□□□ -1.11
REX3
Q12090
YBR232C
YBR232C
360 nt
8.13
□□□□□ -1.11
REX3
Q12090
DUR3
YHL016C
2208 nt
8.11
□□□□□ -1.11
REX3
Q12090
GCD11
YER025W
1584 nt
8.1
□□□□□ -1.11
REX3
Q12090
IMO32
YGR031W
1029 nt
8.1
□□□□□ -1.11
REX3
Q12090
YIL100C-A
YIL100C-A
339 nt
8.1
□□□□□ -1.11
REX3
Q12090
KRE1
YNL322C
942 nt
8.08
□□□□□ -1.12
REX3
Q12090
TUB4
YLR212C
1422 nt
8.07
□□□□□ -1.12
REX3
Q12090
HEM13
YDR044W
987 nt
8.07
□□□□□ -1.12
REX3
Q12090
YHR131C
YHR131C
2553 nt
8.07
□□□□□ -1.12
REX3
Q12090
ECM27
YJR106W
2178 nt
8.06
□□□□□ -1.12
REX3
Q12090
ADE8
YDR408C
645 nt
8.06
□□□□□ -1.12
REX3
Q12090
YJL064W
YJL064W
396 nt
8.06
□□□□□ -1.12
REX3
Q12090
YJL045W
YJL045W
1905 nt
8.05
□□□□□ -1.12
REX3
Q12090
SPS100
YHR139C
981 nt
8.05
□□□□□ -1.12
REX3
Q12090
YEL023C
YEL023C
2049 nt
8.05
□□□□□ -1.12
REX3
Q12090
AAC3
YBR085W
924 nt
8.04
□□□□□ -1.12
REX3
Q12090
MAM3
YOL060C
2121 nt
8.03
□□□□□ -1.12
REX3
Q12090
ACH1
YBL015W
1581 nt
8.03
□□□□□ -1.12
REX3
Q12090
RRT8
YOL048C
1029 nt
8.03
□□□□□ -1.12
REX3
Q12090
ENT4
YLL038C
744 nt
8.02
□□□□□ -1.13
REX3
Q12090
PAU19
YMR325W
375 nt
8.02
□□□□□ -1.13
REX3
Q12090
PUP1
YOR157C
786 nt
8.02
□□□□□ -1.13
REX3
Q12090
HOL1
YNR055C
1761 nt
8.02
□□□□□ -1.13
REX3
Q12090
TAT2
YOL020W
1779 nt
8.01
□□□□□ -1.13
REX3
Q12090
ERG13
YML126C
1476 nt
8
□□□□□ -1.13
REX3
Q12090
MDL2
YPL270W
2322 nt
8
□□□□□ -1.13
REX3
Q12090
YJR114W
YJR114W
393 nt
8
□□□□□ -1.13
REX3
Q12090
ABZ2
YMR289W
1125 nt
8
□□□□□ -1.13
REX3
Q12090
ENO2
YHR174W
1314 nt
8
□□□□□ -1.13
REX3
Q12090
AIM1
YAL046C
357 nt
7.99
□□□□□ -1.13
REX3
Q12090
CCT2
YIL142W
1584 nt
7.98
□□□□□ -1.13
REX3
Q12090
TIM44
YIL022W
1296 nt
7.98
□□□□□ -1.13
REX3
Q12090
APS2
YJR058C
444 nt
7.98
□□□□□ -1.13
REX3
Q12090
CBK1
YNL161W
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7.98
□□□□□ -1.13
REX3
Q12090
TVP23
YDR084C
600 nt
7.97
□□□□□ -1.13
REX3
Q12090
YDR455C
YDR455C
309 nt
7.97
□□□□□ -1.13
REX3
Q12090
YMR209C
YMR209C
1374 nt
7.96
□□□□□ -1.14
REX3
Q12090
YFR036W-A
YFR036W-A
651 nt
7.95
□□□□□ -1.14
REX3
Q12090
NIF3
YGL221C
867 nt
7.95
□□□□□ -1.14
REX3
Q12090
YLR046C
YLR046C
813 nt
7.95
□□□□□ -1.14
REX3
Q12090
OPI10
YOL032W
741 nt
7.95
□□□□□ -1.14
REX3
Q12090
ECM10
YEL030W
1935 nt
7.95
□□□□□ -1.14
REX3
Q12090
TIP1
YBR067C
633 nt
7.94
□□□□□ -1.14
REX3
Q12090
DIG1
YPL049C
1359 nt
7.94
□□□□□ -1.14
REX3
Q12090
IGD1
YFR017C
588 nt
7.93
□□□□□ -1.14
REX3
Q12090
ADE5,7
YGL234W
2409 nt
7.93
□□□□□ -1.14
REX3
Q12090
SPE2
YOL052C
1191 nt
7.92
□□□□□ -1.14
REX3
Q12090
YOR325W
YOR325W
474 nt
7.91
□□□□□ -1.14
REX3
Q12090
YCR025C
YCR025C
411 nt
7.9
□□□□□ -1.14
REX3
Q12090
STF1
YDL130W-A
261 nt
7.9
□□□□□ -1.14
REX3
Q12090
MGM101
YJR144W
810 nt
7.9
□□□□□ -1.14
REX3
Q12090
SLG1
YOR008C
1137 nt
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□□□□□ -1.14
REX3
Q12090
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YPR176C
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□□□□□ -1.14
REX3
Q12090
QDR2
YIL121W
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7.89
□□□□□ -1.15
REX3
Q12090
LPD1
YFL018C
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□□□□□ -1.15
REX3
Q12090
AMF1
YOR378W
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7.88
□□□□□ -1.15
REX3
Q12090
OPI3
YJR073C
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7.87
□□□□□ -1.15
REX3
Q12090
YNR064C
YNR064C
873 nt
7.87
□□□□□ -1.15
REX3
Q12090
TPC1
YGR096W
945 nt
7.86
□□□□□ -1.15
REX3
Q12090
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7.85
□□□□□ -1.15
REX3
Q12090
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YPL209C
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□□□□□ -1.15
REX3
Q12090
LEU2
YCL018W
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□□□□□ -1.15
REX3
Q12090
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YNL117W
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□□□□□ -1.15
REX3
Q12090
UBP13
YBL067C
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7.84
□□□□□ -1.15
REX3
Q12090
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YJL100W
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7.84
□□□□□ -1.15
REX3
Q12090
THP3
YPR045C
1413 nt
7.84
□□□□□ -1.15
REX3
Q12090
GUT1
YHL032C
2130 nt
7.84
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
tA(AGC)D
tA(AGC)D
73 nt
7.83
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
tA(AGC)F
tA(AGC)F
73 nt
7.83
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
tA(AGC)G
tA(AGC)G
73 nt
7.83
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
tA(AGC)H
tA(AGC)H
73 nt
7.83
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
tA(AGC)J
tA(AGC)J
73 nt
7.83
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
tA(AGC)K1
tA(AGC)K1
73 nt
7.83
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
tA(AGC)K2
tA(AGC)K2
73 nt
7.83
□□□□□ -1.16
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