Protein–RNA interactions for Protein: Q07953

SDO1, Ribosome maturation protein SDO1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SDO1Q07953 PUS7YOR243C 2031 nt7.53□□□□□ -1.2
SDO1Q07953 LSM5YER146W 282 nt7.53□□□□□ -1.2
SDO1Q07953 VMA11YPL234C 495 nt7.53□□□□□ -1.2
SDO1Q07953 BNI5YNL166C 1347 nt7.52□□□□□ -1.2
SDO1Q07953 ECM10YEL030W 1935 nt7.52□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 LEU4YNL104C 1860 nt7.51□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 HBS1YKR084C 1836 nt7.51□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 CLB6YGR109C 1143 nt7.51□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 FUB1YCR076C 753 nt7.5□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 YSR3YKR053C 1215 nt7.5□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 FET5YFL041W 1869 nt7.49□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 TAT2YOL020W 1779 nt7.49□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.49□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.49□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.49□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.49□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 SNX3YOR357C 489 nt7.49□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 FIT1YDR534C 1587 nt7.49□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 DPL1YDR294C 1770 nt7.48□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 LPD1YFL018C 1500 nt7.48□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 RRT5YFR032C 870 nt7.48□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 KRR1YCL059C 951 nt7.47□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 YCR087WYCR087W 516 nt7.47□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 RPL4BYDR012W 1089 nt7.47□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 THI74YDR438W 1113 nt7.47□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 RPL4AYBR031W 1089 nt7.47□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 NPP2YEL016C 1482 nt7.47□□□□□ -1.21
SDO1Q07953 SOL2YCR073W-A 948 nt7.46□□□□□ -1.22
SDO1Q07953 RPS14BYJL191W 417 nt7.46□□□□□ -1.22
SDO1Q07953 MSC1YML128C 1542 nt7.46□□□□□ -1.22
SDO1Q07953 YDR467CYDR467C 327 nt7.44□□□□□ -1.22
SDO1Q07953 RAS2YNL098C 969 nt7.44□□□□□ -1.22
SDO1Q07953 ORT1YOR130C 879 nt7.44□□□□□ -1.22
SDO1Q07953 GPN2YOR262W 1044 nt7.44□□□□□ -1.22
SDO1Q07953 XYL2YLR070C 1071 nt7.43□□□□□ -1.22
SDO1Q07953 snR4snR4 186 nt7.43□□□□□ -1.22
SDO1Q07953 YDR094WYDR094W 336 nt7.42□□□□□ -1.22
SDO1Q07953 AIM45YPR004C 1035 nt7.42□□□□□ -1.22
SDO1Q07953 TRP2YER090W 1524 nt7.42□□□□□ -1.22
SDO1Q07953 DUS3YLR401C 2007 nt7.41□□□□□ -1.22
SDO1Q07953 PAU16YKL224C 372 nt7.41□□□□□ -1.22
SDO1Q07953 YEL023CYEL023C 2049 nt7.4□□□□□ -1.22
SDO1Q07953 NUC1YJL208C 990 nt7.4□□□□□ -1.22
SDO1Q07953 POP2YNR052C 1302 nt7.39□□□□□ -1.23
SDO1Q07953 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.38□□□□□ -1.23
SDO1Q07953 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.38□□□□□ -1.23
SDO1Q07953 HXT12YIL170W 1374 nt7.37□□□□□ -1.23
SDO1Q07953 ADE16YLR028C 1776 nt7.37□□□□□ -1.23
SDO1Q07953 YDR455CYDR455C 309 nt7.36□□□□□ -1.23
SDO1Q07953 YGL034CYGL034C 366 nt7.36□□□□□ -1.23
SDO1Q07953 GND1YHR183W 1470 nt7.36□□□□□ -1.23
SDO1Q07953 HXT11YOL156W 1704 nt7.35□□□□□ -1.23
SDO1Q07953 EMC3YKL207W 762 nt7.35□□□□□ -1.23
SDO1Q07953 YMR244WYMR244W 1068 nt7.35□□□□□ -1.23
SDO1Q07953 YLR279WYLR279W 390 nt7.34□□□□□ -1.23
SDO1Q07953 ERG13YML126C 1476 nt7.33□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 GUT1YHL032C 2130 nt7.33□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 APT2YDR441C 546 nt7.32□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 FCY21YER060W 1587 nt7.31□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 SRM1YGL097W 1449 nt7.31□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 NAT4YMR069W 858 nt7.31□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 MSB4YOL112W 1479 nt7.3□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 ELO1YJL196C 933 nt7.3□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 YBL095WYBL095W 813 nt7.3□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 TSC10YBR265W 963 nt7.3□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 AAT1YKL106W 1356 nt7.3□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 YMR265CYMR265C 1386 nt7.3□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 CSM1YCR086W 573 nt7.29□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 PFS2YNL317W 1398 nt7.29□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 FTH1YBR207W 1398 nt7.29□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 YIL177CYIL177C 5277 nt7.29□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 MET30YIL046W 1923 nt7.29□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 SAC7YDR389W 1965 nt7.28□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 EAF3YPR023C 1206 nt7.28□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 Q0010Q0010 387 nt7.28□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.28□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.28□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.28□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 HSV2YGR223C 1347 nt7.27□□□□□ -1.24
SDO1Q07953 YJL045WYJL045W 1905 nt7.27□□□□□ -1.25
SDO1Q07953 STF1YDL130W-A 261 nt7.27□□□□□ -1.25
SDO1Q07953 RPN14YGL004C 1254 nt7.27□□□□□ -1.25
SDO1Q07953 OYE2YHR179W 1203 nt7.27□□□□□ -1.25
SDO1Q07953 HAP5YOR358W 729 nt7.27□□□□□ -1.25
SDO1Q07953 YMC2YBR104W 990 nt7.27□□□□□ -1.25
SDO1Q07953 CCR4YAL021C 2514 nt7.25□□□□□ -1.25
SDO1Q07953 GPM1YKL152C 744 nt7.25□□□□□ -1.25
SDO1Q07953 LOT5YKL183W 921 nt7.25□□□□□ -1.25
SDO1Q07953 DDI1YER143W 1287 nt7.24□□□□□ -1.25
SDO1Q07953 YNL190WYNL190W 615 nt7.24□□□□□ -1.25
SDO1Q07953 YMR210WYMR210W 1350 nt7.23□□□□□ -1.25
SDO1Q07953 PMA2YPL036W 2844 nt7.23□□□□□ -1.25
SDO1Q07953 YGR012WYGR012W 1182 nt7.23□□□□□ -1.25
SDO1Q07953 YNR064CYNR064C 873 nt7.22□□□□□ -1.25
SDO1Q07953 DIA4YHR011W 1341 nt7.22□□□□□ -1.25
SDO1Q07953 RPT5YOR117W 1305 nt7.22□□□□□ -1.25
SDO1Q07953 SAM3YPL274W 1764 nt7.21□□□□□ -1.25
SDO1Q07953 PRY1YJL079C 900 nt7.21□□□□□ -1.26
SDO1Q07953 MDH2YOL126C 1134 nt7.21□□□□□ -1.26
SDO1Q07953 TPS1YBR126C 1488 nt7.21□□□□□ -1.26
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