Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msx2Q03358 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msx2Q03358 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msx2Q03358 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msx2Q03358 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msx2Q03358 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msx2Q03358 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msx2Q03358 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msx2Q03358 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msx2Q03358 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msx2Q03358 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msx2Q03358 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Msx2Q03358 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msx2Q03358 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msx2Q03358 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msx2Q03358 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msx2Q03358 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msx2Q03358 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msx2Q03358 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msx2Q03358 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msx2Q03358 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msx2Q03358 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msx2Q03358 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msx2Q03358 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msx2Q03358 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msx2Q03358 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msx2Q03358 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msx2Q03358 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msx2Q03358 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msx2Q03358 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msx2Q03358 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Msx2Q03358 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Msx2Q03358 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Msx2Q03358 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Msx2Q03358 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msx2Q03358 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msx2Q03358 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msx2Q03358 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msx2Q03358 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msx2Q03358 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msx2Q03358 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msx2Q03358 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msx2Q03358 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msx2Q03358 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msx2Q03358 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msx2Q03358 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msx2Q03358 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msx2Q03358 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Msx2Q03358 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Msx2Q03358 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Msx2Q03358 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msx2Q03358 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msx2Q03358 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msx2Q03358 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msx2Q03358 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Msx2Q03358 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msx2Q03358 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msx2Q03358 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Msx2Q03358 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msx2Q03358 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Msx2Q03358 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msx2Q03358 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msx2Q03358 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msx2Q03358 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msx2Q03358 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msx2Q03358 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msx2Q03358 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msx2Q03358 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msx2Q03358 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Msx2Q03358 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msx2Q03358 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msx2Q03358 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms