Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Thbs2Q03350 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Thbs2Q03350 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Thbs2Q03350 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Thbs2Q03350 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Thbs2Q03350 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Thbs2Q03350 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Thbs2Q03350 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Thbs2Q03350 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Thbs2Q03350 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Thbs2Q03350 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Thbs2Q03350 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Thbs2Q03350 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Thbs2Q03350 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Thbs2Q03350 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Thbs2Q03350 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Thbs2Q03350 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Thbs2Q03350 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Thbs2Q03350 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Thbs2Q03350 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Thbs2Q03350 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Thbs2Q03350 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Thbs2Q03350 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thbs2Q03350 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thbs2Q03350 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thbs2Q03350 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thbs2Q03350 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Thbs2Q03350 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Thbs2Q03350 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Thbs2Q03350 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Thbs2Q03350 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Thbs2Q03350 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thbs2Q03350 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thbs2Q03350 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Thbs2Q03350 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Thbs2Q03350 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thbs2Q03350 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thbs2Q03350 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thbs2Q03350 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thbs2Q03350 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thbs2Q03350 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thbs2Q03350 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thbs2Q03350 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thbs2Q03350 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thbs2Q03350 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thbs2Q03350 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thbs2Q03350 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thbs2Q03350 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thbs2Q03350 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thbs2Q03350 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thbs2Q03350 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thbs2Q03350 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thbs2Q03350 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thbs2Q03350 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thbs2Q03350 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thbs2Q03350 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thbs2Q03350 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thbs2Q03350 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thbs2Q03350 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thbs2Q03350 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Thbs2Q03350 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Thbs2Q03350 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Thbs2Q03350 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Thbs2Q03350 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms