Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gbp1Q01514 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gbp1Q01514 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gbp1Q01514 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gbp1Q01514 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gbp1Q01514 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gbp1Q01514 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gbp1Q01514 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gbp1Q01514 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gbp1Q01514 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gbp1Q01514 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gbp1Q01514 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gbp1Q01514 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gbp1Q01514 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gbp1Q01514 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gbp1Q01514 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gbp1Q01514 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gbp1Q01514 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gbp1Q01514 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gbp1Q01514 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gbp1Q01514 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gbp1Q01514 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gbp1Q01514 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gbp1Q01514 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gbp1Q01514 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gbp1Q01514 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gbp1Q01514 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gbp1Q01514 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gbp1Q01514 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gbp1Q01514 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gbp1Q01514 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gbp1Q01514 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gbp1Q01514 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gbp1Q01514 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gbp1Q01514 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gbp1Q01514 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gbp1Q01514 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gbp1Q01514 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gbp1Q01514 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gbp1Q01514 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gbp1Q01514 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Gbp1Q01514 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gbp1Q01514 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Gbp1Q01514 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gbp1Q01514 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gbp1Q01514 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gbp1Q01514 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gbp1Q01514 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gbp1Q01514 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gbp1Q01514 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gbp1Q01514 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gbp1Q01514 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gbp1Q01514 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gbp1Q01514 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gbp1Q01514 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gbp1Q01514 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gbp1Q01514 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gbp1Q01514 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gbp1Q01514 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gbp1Q01514 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gbp1Q01514 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gbp1Q01514 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gbp1Q01514 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gbp1Q01514 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gbp1Q01514 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gbp1Q01514 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gbp1Q01514 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gbp1Q01514 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gbp1Q01514 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gbp1Q01514 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gbp1Q01514 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gbp1Q01514 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gbp1Q01514 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gbp1Q01514 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gbp1Q01514 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gbp1Q01514 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gbp1Q01514 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gbp1Q01514 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gbp1Q01514 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gbp1Q01514 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gbp1Q01514 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gbp1Q01514 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gbp1Q01514 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gbp1Q01514 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gbp1Q01514 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gbp1Q01514 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gbp1Q01514 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gbp1Q01514 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gbp1Q01514 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gbp1Q01514 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gbp1Q01514 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Gbp1Q01514 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gbp1Q01514 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gbp1Q01514 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gbp1Q01514 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gbp1Q01514 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gbp1Q01514 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gbp1Q01514 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gbp1Q01514 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gbp1Q01514 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms