Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Col1a2Q01149 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Col1a2Q01149 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,61
Col1a2Q01149 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Col1a2Q01149 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Col1a2Q01149 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Col1a2Q01149 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Col1a2Q01149 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Col1a2Q01149 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,35■■■□□ 2,61
Col1a2Q01149 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC31,34■■■□□ 2,61
Col1a2Q01149 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Col1a2Q01149 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Col1a2Q01149 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Col1a2Q01149 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Col1a2Q01149 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Col1a2Q01149 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31,32■■■□□ 2,6
Col1a2Q01149 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Col1a2Q01149 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC31,31■■■□□ 2,6
Col1a2Q01149 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Col1a2Q01149 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31,29■■■□□ 2,6
Col1a2Q01149 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Col1a2Q01149 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Col1a2Q01149 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Col1a2Q01149 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Col1a2Q01149 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Col1a2Q01149 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Col1a2Q01149 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Col1a2Q01149 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Col1a2Q01149 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Col1a2Q01149 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Col1a2Q01149 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Col1a2Q01149 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Col1a2Q01149 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Col1a2Q01149 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Col1a2Q01149 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Col1a2Q01149 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Col1a2Q01149 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC31,18■■■□□ 2,58
Col1a2Q01149 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Col1a2Q01149 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Col1a2Q01149 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC31,18■■■□□ 2,58
Col1a2Q01149 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,17■■■□□ 2,58
Col1a2Q01149 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Col1a2Q01149 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Col1a2Q01149 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Col1a2Q01149 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Col1a2Q01149 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Col1a2Q01149 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Col1a2Q01149 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,57
Col1a2Q01149 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Col1a2Q01149 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Col1a2Q01149 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Col1a2Q01149 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Col1a2Q01149 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Col1a2Q01149 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Col1a2Q01149 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Col1a2Q01149 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31,08■■■□□ 2,57
Col1a2Q01149 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,57
Col1a2Q01149 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Col1a2Q01149 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Col1a2Q01149 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Col1a2Q01149 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Col1a2Q01149 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Col1a2Q01149 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Col1a2Q01149 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Col1a2Q01149 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC31,05■■■□□ 2,56
Col1a2Q01149 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Col1a2Q01149 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Col1a2Q01149 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Col1a2Q01149 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC31,03■■■□□ 2,56
Col1a2Q01149 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31,01■■■□□ 2,56
Col1a2Q01149 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC31,01■■■□□ 2,55
Col1a2Q01149 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2,55
Col1a2Q01149 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2,55
Col1a2Q01149 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Col1a2Q01149 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Col1a2Q01149 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Col1a2Q01149 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Col1a2Q01149 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Col1a2Q01149 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Col1a2Q01149 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Col1a2Q01149 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Col1a2Q01149 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Col1a2Q01149 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,97■■■□□ 2,55
Col1a2Q01149 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Col1a2Q01149 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Col1a2Q01149 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Col1a2Q01149 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Col1a2Q01149 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Col1a2Q01149 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
Col1a2Q01149 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30,95■■■□□ 2,54
Col1a2Q01149 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30,94■■■□□ 2,54
Col1a2Q01149 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC30,94■■■□□ 2,54
Col1a2Q01149 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Col1a2Q01149 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Col1a2Q01149 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Col1a2Q01149 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30,92■■■□□ 2,54
Col1a2Q01149 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Col1a2Q01149 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Col1a2Q01149 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Col1a2Q01149 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30,89■■■□□ 2,54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,4 ms