Protein–RNA interactions for Protein: P82343

Renbp, N-acylglucosamine 2-epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RenbpP82343 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RenbpP82343 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RenbpP82343 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RenbpP82343 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RenbpP82343 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RenbpP82343 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RenbpP82343 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RenbpP82343 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RenbpP82343 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RenbpP82343 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RenbpP82343 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RenbpP82343 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RenbpP82343 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RenbpP82343 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RenbpP82343 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RenbpP82343 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RenbpP82343 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RenbpP82343 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RenbpP82343 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RenbpP82343 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RenbpP82343 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RenbpP82343 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RenbpP82343 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RenbpP82343 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RenbpP82343 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RenbpP82343 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RenbpP82343 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RenbpP82343 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RenbpP82343 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RenbpP82343 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RenbpP82343 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RenbpP82343 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RenbpP82343 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RenbpP82343 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RenbpP82343 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RenbpP82343 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RenbpP82343 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RenbpP82343 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RenbpP82343 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RenbpP82343 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RenbpP82343 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RenbpP82343 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RenbpP82343 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RenbpP82343 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RenbpP82343 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RenbpP82343 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RenbpP82343 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RenbpP82343 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RenbpP82343 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RenbpP82343 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RenbpP82343 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RenbpP82343 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RenbpP82343 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RenbpP82343 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RenbpP82343 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RenbpP82343 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RenbpP82343 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RenbpP82343 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RenbpP82343 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RenbpP82343 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RenbpP82343 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RenbpP82343 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RenbpP82343 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RenbpP82343 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RenbpP82343 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RenbpP82343 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RenbpP82343 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RenbpP82343 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RenbpP82343 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RenbpP82343 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RenbpP82343 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RenbpP82343 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RenbpP82343 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RenbpP82343 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RenbpP82343 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RenbpP82343 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RenbpP82343 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RenbpP82343 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RenbpP82343 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RenbpP82343 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RenbpP82343 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RenbpP82343 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RenbpP82343 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RenbpP82343 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RenbpP82343 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RenbpP82343 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RenbpP82343 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RenbpP82343 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RenbpP82343 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RenbpP82343 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RenbpP82343 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RenbpP82343 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RenbpP82343 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RenbpP82343 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RenbpP82343 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RenbpP82343 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RenbpP82343 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RenbpP82343 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RenbpP82343 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RenbpP82343 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms