Protein–RNA interactions for Protein: P70288

Hdac2, Histone deacetylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac2P70288 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac2P70288 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac2P70288 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac2P70288 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac2P70288 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac2P70288 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac2P70288 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac2P70288 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac2P70288 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac2P70288 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac2P70288 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac2P70288 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac2P70288 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac2P70288 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac2P70288 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac2P70288 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac2P70288 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac2P70288 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac2P70288 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac2P70288 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac2P70288 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac2P70288 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac2P70288 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac2P70288 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac2P70288 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac2P70288 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac2P70288 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac2P70288 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac2P70288 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac2P70288 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac2P70288 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac2P70288 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac2P70288 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac2P70288 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac2P70288 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac2P70288 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac2P70288 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac2P70288 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac2P70288 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac2P70288 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac2P70288 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac2P70288 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac2P70288 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac2P70288 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac2P70288 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac2P70288 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac2P70288 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac2P70288 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac2P70288 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac2P70288 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac2P70288 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac2P70288 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac2P70288 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac2P70288 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac2P70288 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac2P70288 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac2P70288 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac2P70288 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac2P70288 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac2P70288 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac2P70288 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac2P70288 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac2P70288 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac2P70288 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac2P70288 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac2P70288 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms