Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd6P61407 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd6P61407 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd6P61407 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd6P61407 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tdrd6P61407 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tdrd6P61407 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tdrd6P61407 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tdrd6P61407 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tdrd6P61407 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tdrd6P61407 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tdrd6P61407 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tdrd6P61407 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tdrd6P61407 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tdrd6P61407 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tdrd6P61407 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tdrd6P61407 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tdrd6P61407 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tdrd6P61407 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd6P61407 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd6P61407 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tdrd6P61407 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tdrd6P61407 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tdrd6P61407 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tdrd6P61407 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tdrd6P61407 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tdrd6P61407 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd6P61407 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd6P61407 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd6P61407 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd6P61407 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd6P61407 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd6P61407 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd6P61407 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd6P61407 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd6P61407 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd6P61407 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd6P61407 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd6P61407 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd6P61407 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd6P61407 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tdrd6P61407 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tdrd6P61407 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd6P61407 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd6P61407 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd6P61407 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd6P61407 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd6P61407 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd6P61407 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd6P61407 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd6P61407 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd6P61407 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd6P61407 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd6P61407 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd6P61407 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd6P61407 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd6P61407 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd6P61407 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd6P61407 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd6P61407 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd6P61407 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tdrd6P61407 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tdrd6P61407 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tdrd6P61407 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd6P61407 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd6P61407 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd6P61407 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tdrd6P61407 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tdrd6P61407 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tdrd6P61407 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tdrd6P61407 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd6P61407 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tdrd6P61407 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tdrd6P61407 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd6P61407 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd6P61407 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd6P61407 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd6P61407 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd6P61407 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd6P61407 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd6P61407 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd6P61407 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd6P61407 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd6P61407 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd6P61407 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd6P61407 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd6P61407 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd6P61407 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd6P61407 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd6P61407 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd6P61407 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd6P61407 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tdrd6P61407 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd6P61407 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd6P61407 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd6P61407 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd6P61407 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd6P61407 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd6P61407 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd6P61407 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms