Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Siah1aP61092 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Siah1aP61092 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Siah1aP61092 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Siah1aP61092 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Siah1aP61092 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Siah1aP61092 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Siah1aP61092 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Siah1aP61092 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Siah1aP61092 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Siah1aP61092 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Siah1aP61092 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Siah1aP61092 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Siah1aP61092 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Siah1aP61092 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Siah1aP61092 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Siah1aP61092 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Siah1aP61092 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Siah1aP61092 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Siah1aP61092 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Siah1aP61092 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Siah1aP61092 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Siah1aP61092 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Siah1aP61092 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Siah1aP61092 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Siah1aP61092 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Siah1aP61092 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Siah1aP61092 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Siah1aP61092 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Siah1aP61092 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Siah1aP61092 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Siah1aP61092 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Siah1aP61092 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Siah1aP61092 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Siah1aP61092 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Siah1aP61092 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Siah1aP61092 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Siah1aP61092 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Siah1aP61092 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Siah1aP61092 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Siah1aP61092 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Siah1aP61092 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Siah1aP61092 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Siah1aP61092 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Siah1aP61092 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Siah1aP61092 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Siah1aP61092 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Siah1aP61092 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Siah1aP61092 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Siah1aP61092 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Siah1aP61092 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Siah1aP61092 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Siah1aP61092 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Siah1aP61092 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Siah1aP61092 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Siah1aP61092 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Siah1aP61092 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Siah1aP61092 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Siah1aP61092 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Siah1aP61092 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Siah1aP61092 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Siah1aP61092 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Siah1aP61092 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Siah1aP61092 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Siah1aP61092 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Siah1aP61092 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Siah1aP61092 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Siah1aP61092 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Siah1aP61092 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Siah1aP61092 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Siah1aP61092 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Siah1aP61092 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Siah1aP61092 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Siah1aP61092 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Siah1aP61092 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Siah1aP61092 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Siah1aP61092 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Siah1aP61092 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Siah1aP61092 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Siah1aP61092 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Siah1aP61092 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Siah1aP61092 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Siah1aP61092 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Siah1aP61092 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Siah1aP61092 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Siah1aP61092 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Siah1aP61092 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Siah1aP61092 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Siah1aP61092 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Siah1aP61092 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Siah1aP61092 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Siah1aP61092 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Siah1aP61092 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Siah1aP61092 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Siah1aP61092 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Siah1aP61092 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Siah1aP61092 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Siah1aP61092 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Siah1aP61092 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Siah1aP61092 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms