Protein–RNA interactions for Protein: P59808

Sash1, SAM and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash1P59808 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sash1P59808 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sash1P59808 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sash1P59808 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sash1P59808 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sash1P59808 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sash1P59808 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sash1P59808 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sash1P59808 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sash1P59808 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sash1P59808 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sash1P59808 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sash1P59808 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sash1P59808 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sash1P59808 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sash1P59808 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sash1P59808 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sash1P59808 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sash1P59808 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sash1P59808 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sash1P59808 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sash1P59808 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sash1P59808 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sash1P59808 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sash1P59808 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sash1P59808 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sash1P59808 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sash1P59808 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sash1P59808 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sash1P59808 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sash1P59808 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sash1P59808 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sash1P59808 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sash1P59808 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sash1P59808 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sash1P59808 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Sash1P59808 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Sash1P59808 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sash1P59808 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sash1P59808 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sash1P59808 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sash1P59808 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sash1P59808 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sash1P59808 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sash1P59808 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sash1P59808 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sash1P59808 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sash1P59808 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sash1P59808 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sash1P59808 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sash1P59808 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sash1P59808 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sash1P59808 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sash1P59808 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sash1P59808 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sash1P59808 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sash1P59808 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sash1P59808 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sash1P59808 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sash1P59808 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sash1P59808 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sash1P59808 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sash1P59808 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sash1P59808 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sash1P59808 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sash1P59808 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sash1P59808 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sash1P59808 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sash1P59808 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sash1P59808 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sash1P59808 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sash1P59808 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sash1P59808 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sash1P59808 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sash1P59808 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sash1P59808 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sash1P59808 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sash1P59808 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sash1P59808 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sash1P59808 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sash1P59808 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sash1P59808 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sash1P59808 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sash1P59808 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sash1P59808 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sash1P59808 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sash1P59808 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sash1P59808 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sash1P59808 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sash1P59808 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sash1P59808 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sash1P59808 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sash1P59808 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sash1P59808 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sash1P59808 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sash1P59808 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sash1P59808 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sash1P59808 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sash1P59808 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sash1P59808 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms