Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TdgP56581 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TdgP56581 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TdgP56581 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TdgP56581 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TdgP56581 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TdgP56581 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TdgP56581 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TdgP56581 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TdgP56581 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TdgP56581 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TdgP56581 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TdgP56581 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TdgP56581 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TdgP56581 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TdgP56581 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TdgP56581 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TdgP56581 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TdgP56581 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TdgP56581 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TdgP56581 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TdgP56581 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TdgP56581 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TdgP56581 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TdgP56581 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TdgP56581 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TdgP56581 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TdgP56581 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TdgP56581 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TdgP56581 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TdgP56581 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TdgP56581 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TdgP56581 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TdgP56581 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TdgP56581 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TdgP56581 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TdgP56581 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TdgP56581 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TdgP56581 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TdgP56581 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TdgP56581 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TdgP56581 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TdgP56581 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TdgP56581 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TdgP56581 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TdgP56581 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TdgP56581 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TdgP56581 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TdgP56581 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TdgP56581 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TdgP56581 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TdgP56581 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TdgP56581 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TdgP56581 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
TdgP56581 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TdgP56581 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TdgP56581 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TdgP56581 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TdgP56581 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TdgP56581 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TdgP56581 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TdgP56581 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TdgP56581 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TdgP56581 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TdgP56581 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TdgP56581 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TdgP56581 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TdgP56581 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TdgP56581 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TdgP56581 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TdgP56581 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TdgP56581 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TdgP56581 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TdgP56581 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TdgP56581 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TdgP56581 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TdgP56581 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TdgP56581 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TdgP56581 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TdgP56581 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TdgP56581 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TdgP56581 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TdgP56581 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TdgP56581 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TdgP56581 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TdgP56581 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TdgP56581 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TdgP56581 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TdgP56581 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TdgP56581 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TdgP56581 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TdgP56581 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TdgP56581 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TdgP56581 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TdgP56581 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TdgP56581 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TdgP56581 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TdgP56581 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TdgP56581 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TdgP56581 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms