Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gp1bbP56400 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gp1bbP56400 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gp1bbP56400 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gp1bbP56400 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Gp1bbP56400 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gp1bbP56400 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gp1bbP56400 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gp1bbP56400 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gp1bbP56400 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gp1bbP56400 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gp1bbP56400 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gp1bbP56400 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gp1bbP56400 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gp1bbP56400 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gp1bbP56400 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gp1bbP56400 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gp1bbP56400 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gp1bbP56400 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gp1bbP56400 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gp1bbP56400 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gp1bbP56400 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gp1bbP56400 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gp1bbP56400 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gp1bbP56400 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gp1bbP56400 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gp1bbP56400 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gp1bbP56400 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gp1bbP56400 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gp1bbP56400 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gp1bbP56400 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gp1bbP56400 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gp1bbP56400 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gp1bbP56400 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gp1bbP56400 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gp1bbP56400 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gp1bbP56400 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gp1bbP56400 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gp1bbP56400 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gp1bbP56400 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gp1bbP56400 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gp1bbP56400 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gp1bbP56400 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Gp1bbP56400 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gp1bbP56400 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gp1bbP56400 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gp1bbP56400 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gp1bbP56400 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gp1bbP56400 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gp1bbP56400 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gp1bbP56400 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gp1bbP56400 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gp1bbP56400 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gp1bbP56400 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gp1bbP56400 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gp1bbP56400 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gp1bbP56400 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gp1bbP56400 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gp1bbP56400 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gp1bbP56400 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gp1bbP56400 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gp1bbP56400 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gp1bbP56400 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gp1bbP56400 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gp1bbP56400 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gp1bbP56400 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gp1bbP56400 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gp1bbP56400 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gp1bbP56400 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gp1bbP56400 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gp1bbP56400 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gp1bbP56400 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gp1bbP56400 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gp1bbP56400 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gp1bbP56400 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gp1bbP56400 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gp1bbP56400 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gp1bbP56400 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gp1bbP56400 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gp1bbP56400 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gp1bbP56400 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gp1bbP56400 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gp1bbP56400 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gp1bbP56400 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gp1bbP56400 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gp1bbP56400 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Gp1bbP56400 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gp1bbP56400 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gp1bbP56400 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms