Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNU13P55769 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNU13P55769 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNU13P55769 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNU13P55769 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNU13P55769 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNU13P55769 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNU13P55769 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNU13P55769 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNU13P55769 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNU13P55769 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNU13P55769 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNU13P55769 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNU13P55769 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNU13P55769 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNU13P55769 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNU13P55769 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNU13P55769 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNU13P55769 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNU13P55769 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNU13P55769 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNU13P55769 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNU13P55769 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNU13P55769 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNU13P55769 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNU13P55769 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNU13P55769 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNU13P55769 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNU13P55769 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNU13P55769 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNU13P55769 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNU13P55769 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNU13P55769 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNU13P55769 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNU13P55769 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNU13P55769 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNU13P55769 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNU13P55769 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNU13P55769 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNU13P55769 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNU13P55769 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNU13P55769 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNU13P55769 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNU13P55769 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNU13P55769 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNU13P55769 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNU13P55769 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNU13P55769 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNU13P55769 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNU13P55769 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNU13P55769 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNU13P55769 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNU13P55769 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNU13P55769 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNU13P55769 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNU13P55769 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNU13P55769 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNU13P55769 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNU13P55769 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNU13P55769 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNU13P55769 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNU13P55769 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNU13P55769 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNU13P55769 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNU13P55769 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNU13P55769 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNU13P55769 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNU13P55769 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNU13P55769 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNU13P55769 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNU13P55769 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNU13P55769 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNU13P55769 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNU13P55769 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNU13P55769 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNU13P55769 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNU13P55769 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNU13P55769 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNU13P55769 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNU13P55769 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNU13P55769 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNU13P55769 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNU13P55769 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNU13P55769 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNU13P55769 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNU13P55769 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNU13P55769 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNU13P55769 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNU13P55769 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNU13P55769 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNU13P55769 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNU13P55769 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNU13P55769 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNU13P55769 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNU13P55769 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNU13P55769 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNU13P55769 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNU13P55769 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNU13P55769 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNU13P55769 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms