Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NrlP54846 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NrlP54846 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NrlP54846 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NrlP54846 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NrlP54846 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NrlP54846 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NrlP54846 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NrlP54846 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NrlP54846 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NrlP54846 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NrlP54846 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NrlP54846 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NrlP54846 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NrlP54846 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NrlP54846 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NrlP54846 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NrlP54846 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NrlP54846 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NrlP54846 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NrlP54846 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NrlP54846 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NrlP54846 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NrlP54846 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NrlP54846 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NrlP54846 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NrlP54846 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NrlP54846 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NrlP54846 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NrlP54846 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NrlP54846 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NrlP54846 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NrlP54846 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NrlP54846 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NrlP54846 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NrlP54846 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NrlP54846 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NrlP54846 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NrlP54846 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NrlP54846 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NrlP54846 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NrlP54846 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NrlP54846 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NrlP54846 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NrlP54846 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NrlP54846 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NrlP54846 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NrlP54846 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NrlP54846 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NrlP54846 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NrlP54846 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NrlP54846 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NrlP54846 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NrlP54846 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NrlP54846 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NrlP54846 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NrlP54846 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NrlP54846 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NrlP54846 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NrlP54846 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NrlP54846 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NrlP54846 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NrlP54846 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NrlP54846 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NrlP54846 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NrlP54846 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NrlP54846 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NrlP54846 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NrlP54846 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NrlP54846 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NrlP54846 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NrlP54846 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NrlP54846 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NrlP54846 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NrlP54846 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NrlP54846 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NrlP54846 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NrlP54846 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrlP54846 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrlP54846 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrlP54846 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrlP54846 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NrlP54846 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NrlP54846 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NrlP54846 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NrlP54846 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NrlP54846 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NrlP54846 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NrlP54846 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NrlP54846 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NrlP54846 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NrlP54846 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NrlP54846 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NrlP54846 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NrlP54846 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NrlP54846 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NrlP54846 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NrlP54846 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NrlP54846 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NrlP54846 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms