Protein–RNA interactions for Protein: P54763

Ephb2, Ephrin type-B receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb2P54763 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ephb2P54763 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ephb2P54763 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ephb2P54763 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ephb2P54763 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ephb2P54763 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ephb2P54763 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ephb2P54763 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ephb2P54763 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ephb2P54763 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ephb2P54763 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ephb2P54763 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ephb2P54763 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ephb2P54763 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ephb2P54763 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ephb2P54763 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ephb2P54763 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ephb2P54763 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ephb2P54763 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ephb2P54763 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ephb2P54763 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ephb2P54763 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ephb2P54763 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ephb2P54763 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ephb2P54763 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ephb2P54763 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ephb2P54763 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ephb2P54763 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ephb2P54763 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ephb2P54763 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ephb2P54763 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ephb2P54763 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ephb2P54763 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ephb2P54763 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ephb2P54763 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ephb2P54763 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ephb2P54763 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ephb2P54763 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ephb2P54763 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ephb2P54763 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb2P54763 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb2P54763 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb2P54763 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb2P54763 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb2P54763 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb2P54763 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ephb2P54763 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ephb2P54763 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ephb2P54763 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ephb2P54763 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ephb2P54763 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ephb2P54763 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ephb2P54763 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ephb2P54763 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ephb2P54763 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ephb2P54763 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ephb2P54763 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ephb2P54763 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ephb2P54763 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ephb2P54763 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ephb2P54763 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ephb2P54763 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ephb2P54763 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ephb2P54763 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ephb2P54763 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ephb2P54763 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ephb2P54763 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ephb2P54763 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ephb2P54763 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ephb2P54763 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ephb2P54763 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ephb2P54763 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ephb2P54763 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ephb2P54763 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ephb2P54763 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb2P54763 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb2P54763 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb2P54763 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb2P54763 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms