Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl5P47962 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl5P47962 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl5P47962 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl5P47962 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl5P47962 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl5P47962 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl5P47962 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl5P47962 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl5P47962 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl5P47962 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl5P47962 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl5P47962 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl5P47962 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl5P47962 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl5P47962 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl5P47962 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl5P47962 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl5P47962 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl5P47962 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl5P47962 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl5P47962 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl5P47962 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl5P47962 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl5P47962 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl5P47962 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpl5P47962 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl5P47962 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl5P47962 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl5P47962 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl5P47962 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl5P47962 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl5P47962 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl5P47962 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl5P47962 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl5P47962 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl5P47962 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms