Protein–RNA interactions for Protein: P32020

Scp2, Non-specific lipid-transfer protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2P32020 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scp2P32020 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scp2P32020 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scp2P32020 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scp2P32020 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scp2P32020 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scp2P32020 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scp2P32020 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scp2P32020 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scp2P32020 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scp2P32020 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scp2P32020 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scp2P32020 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scp2P32020 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scp2P32020 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Scp2P32020 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scp2P32020 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Scp2P32020 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scp2P32020 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scp2P32020 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scp2P32020 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scp2P32020 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scp2P32020 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scp2P32020 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scp2P32020 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scp2P32020 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scp2P32020 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scp2P32020 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Scp2P32020 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Scp2P32020 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scp2P32020 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scp2P32020 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scp2P32020 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scp2P32020 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scp2P32020 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Scp2P32020 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Scp2P32020 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Scp2P32020 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scp2P32020 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scp2P32020 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Scp2P32020 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scp2P32020 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Scp2P32020 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Scp2P32020 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scp2P32020 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scp2P32020 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scp2P32020 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scp2P32020 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scp2P32020 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scp2P32020 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scp2P32020 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scp2P32020 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scp2P32020 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scp2P32020 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scp2P32020 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scp2P32020 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scp2P32020 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scp2P32020 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scp2P32020 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scp2P32020 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scp2P32020 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scp2P32020 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scp2P32020 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scp2P32020 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scp2P32020 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scp2P32020 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scp2P32020 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scp2P32020 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scp2P32020 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scp2P32020 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scp2P32020 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scp2P32020 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scp2P32020 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scp2P32020 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scp2P32020 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scp2P32020 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scp2P32020 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scp2P32020 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scp2P32020 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scp2P32020 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms