Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cnga1P29974 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cnga1P29974 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cnga1P29974 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cnga1P29974 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cnga1P29974 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cnga1P29974 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cnga1P29974 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cnga1P29974 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cnga1P29974 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cnga1P29974 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cnga1P29974 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cnga1P29974 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cnga1P29974 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cnga1P29974 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cnga1P29974 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cnga1P29974 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cnga1P29974 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cnga1P29974 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cnga1P29974 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Cnga1P29974 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cnga1P29974 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cnga1P29974 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cnga1P29974 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cnga1P29974 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cnga1P29974 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cnga1P29974 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cnga1P29974 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cnga1P29974 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cnga1P29974 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cnga1P29974 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cnga1P29974 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cnga1P29974 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cnga1P29974 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cnga1P29974 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Cnga1P29974 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cnga1P29974 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cnga1P29974 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cnga1P29974 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cnga1P29974 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cnga1P29974 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cnga1P29974 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cnga1P29974 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cnga1P29974 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Cnga1P29974 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cnga1P29974 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cnga1P29974 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cnga1P29974 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cnga1P29974 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cnga1P29974 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cnga1P29974 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cnga1P29974 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cnga1P29974 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cnga1P29974 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cnga1P29974 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cnga1P29974 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cnga1P29974 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cnga1P29974 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cnga1P29974 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cnga1P29974 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cnga1P29974 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Cnga1P29974 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cnga1P29974 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cnga1P29974 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cnga1P29974 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cnga1P29974 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cnga1P29974 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cnga1P29974 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cnga1P29974 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cnga1P29974 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cnga1P29974 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cnga1P29974 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cnga1P29974 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cnga1P29974 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cnga1P29974 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cnga1P29974 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cnga1P29974 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cnga1P29974 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cnga1P29974 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cnga1P29974 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cnga1P29974 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cnga1P29974 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cnga1P29974 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cnga1P29974 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cnga1P29974 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cnga1P29974 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cnga1P29974 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cnga1P29974 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cnga1P29974 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cnga1P29974 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cnga1P29974 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cnga1P29974 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Cnga1P29974 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cnga1P29974 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cnga1P29974 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cnga1P29974 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cnga1P29974 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cnga1P29974 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Cnga1P29974 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cnga1P29974 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms