Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,65■■■□□ 2,98
Cnga1P29974 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Cnga1P29974 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Cnga1P29974 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,61■■■□□ 2,97
Cnga1P29974 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33,58■■■□□ 2,97
Cnga1P29974 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33,58■■■□□ 2,97
Cnga1P29974 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Cnga1P29974 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Cnga1P29974 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Cnga1P29974 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Cnga1P29974 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Cnga1P29974 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Cnga1P29974 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Cnga1P29974 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Cnga1P29974 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Cnga1P29974 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Cnga1P29974 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Cnga1P29974 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Cnga1P29974 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Cnga1P29974 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33,5■■■□□ 2,95
Cnga1P29974 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Cnga1P29974 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Cnga1P29974 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Cnga1P29974 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Cnga1P29974 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Cnga1P29974 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Cnga1P29974 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Cnga1P29974 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,45■■■□□ 2,95
Cnga1P29974 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Cnga1P29974 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Cnga1P29974 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,43■■■□□ 2,94
Cnga1P29974 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Cnga1P29974 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33,43■■■□□ 2,94
Cnga1P29974 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Cnga1P29974 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33,41■■■□□ 2,94
Cnga1P29974 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Cnga1P29974 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Cnga1P29974 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Cnga1P29974 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Cnga1P29974 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Cnga1P29974 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Cnga1P29974 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Cnga1P29974 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Cnga1P29974 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33,35■■■□□ 2,93
Cnga1P29974 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Cnga1P29974 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Cnga1P29974 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Cnga1P29974 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Cnga1P29974 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,31■■■□□ 2,92
Cnga1P29974 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Cnga1P29974 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Cnga1P29974 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Cnga1P29974 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Cnga1P29974 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Cnga1P29974 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Cnga1P29974 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33,29■■■□□ 2,92
Cnga1P29974 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Cnga1P29974 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33,28■■■□□ 2,92
Cnga1P29974 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33,27■■■□□ 2,92
Cnga1P29974 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Cnga1P29974 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33,27■■■□□ 2,92
Cnga1P29974 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33,27■■■□□ 2,92
Cnga1P29974 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Cnga1P29974 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Cnga1P29974 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Cnga1P29974 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33,23■■■□□ 2,91
Cnga1P29974 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Cnga1P29974 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,21■■■□□ 2,91
Cnga1P29974 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Cnga1P29974 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Cnga1P29974 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Cnga1P29974 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Cnga1P29974 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Cnga1P29974 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Cnga1P29974 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Cnga1P29974 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Cnga1P29974 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Cnga1P29974 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Cnga1P29974 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33,15■■■□□ 2,9
Cnga1P29974 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Cnga1P29974 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Cnga1P29974 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Cnga1P29974 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Cnga1P29974 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Cnga1P29974 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Cnga1P29974 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Cnga1P29974 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Cnga1P29974 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Cnga1P29974 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Cnga1P29974 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Cnga1P29974 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC33,12■■■□□ 2,89
Cnga1P29974 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33,12■■■□□ 2,89
Cnga1P29974 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,12■■■□□ 2,89
Cnga1P29974 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Cnga1P29974 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Cnga1P29974 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Cnga1P29974 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Cnga1P29974 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33,1■■■□□ 2,89
Cnga1P29974 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC33,1■■■□□ 2,89
Cnga1P29974 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33,1■■■□□ 2,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,7 ms