Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RxrbP28704 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RxrbP28704 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RxrbP28704 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RxrbP28704 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RxrbP28704 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RxrbP28704 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RxrbP28704 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RxrbP28704 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RxrbP28704 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RxrbP28704 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RxrbP28704 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RxrbP28704 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RxrbP28704 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RxrbP28704 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RxrbP28704 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RxrbP28704 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RxrbP28704 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RxrbP28704 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RxrbP28704 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RxrbP28704 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RxrbP28704 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RxrbP28704 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RxrbP28704 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RxrbP28704 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RxrbP28704 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RxrbP28704 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RxrbP28704 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RxrbP28704 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RxrbP28704 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RxrbP28704 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RxrbP28704 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RxrbP28704 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RxrbP28704 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RxrbP28704 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RxrbP28704 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RxrbP28704 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RxrbP28704 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RxrbP28704 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RxrbP28704 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RxrbP28704 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RxrbP28704 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RxrbP28704 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RxrbP28704 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RxrbP28704 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RxrbP28704 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RxrbP28704 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RxrbP28704 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RxrbP28704 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RxrbP28704 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RxrbP28704 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RxrbP28704 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RxrbP28704 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RxrbP28704 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RxrbP28704 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RxrbP28704 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RxrbP28704 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RxrbP28704 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RxrbP28704 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RxrbP28704 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RxrbP28704 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RxrbP28704 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RxrbP28704 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RxrbP28704 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RxrbP28704 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RxrbP28704 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RxrbP28704 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RxrbP28704 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RxrbP28704 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RxrbP28704 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RxrbP28704 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RxrbP28704 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RxrbP28704 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RxrbP28704 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RxrbP28704 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RxrbP28704 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RxrbP28704 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RxrbP28704 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RxrbP28704 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RxrbP28704 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RxrbP28704 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RxrbP28704 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RxrbP28704 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RxrbP28704 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RxrbP28704 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RxrbP28704 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RxrbP28704 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RxrbP28704 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RxrbP28704 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RxrbP28704 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RxrbP28704 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RxrbP28704 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RxrbP28704 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RxrbP28704 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RxrbP28704 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RxrbP28704 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RxrbP28704 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RxrbP28704 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RxrbP28704 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RxrbP28704 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms