Protein–RNA interactions for Protein: P23906

Irf2, Interferon regulatory factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2P23906 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf2P23906 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf2P23906 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf2P23906 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf2P23906 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf2P23906 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf2P23906 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf2P23906 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf2P23906 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf2P23906 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf2P23906 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf2P23906 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf2P23906 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf2P23906 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf2P23906 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf2P23906 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf2P23906 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf2P23906 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irf2P23906 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irf2P23906 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf2P23906 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf2P23906 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf2P23906 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf2P23906 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf2P23906 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf2P23906 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf2P23906 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf2P23906 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irf2P23906 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf2P23906 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf2P23906 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irf2P23906 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irf2P23906 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf2P23906 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf2P23906 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf2P23906 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf2P23906 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irf2P23906 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Irf2P23906 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf2P23906 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Irf2P23906 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf2P23906 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf2P23906 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf2P23906 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf2P23906 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf2P23906 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf2P23906 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf2P23906 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf2P23906 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf2P23906 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf2P23906 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf2P23906 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf2P23906 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf2P23906 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf2P23906 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf2P23906 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf2P23906 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf2P23906 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf2P23906 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf2P23906 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf2P23906 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf2P23906 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf2P23906 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf2P23906 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf2P23906 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf2P23906 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf2P23906 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf2P23906 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf2P23906 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf2P23906 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irf2P23906 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irf2P23906 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf2P23906 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf2P23906 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf2P23906 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf2P23906 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf2P23906 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf2P23906 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf2P23906 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf2P23906 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf2P23906 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf2P23906 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf2P23906 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf2P23906 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf2P23906 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf2P23906 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf2P23906 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf2P23906 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf2P23906 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf2P23906 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Irf2P23906 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Irf2P23906 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Irf2P23906 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Irf2P23906 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Irf2P23906 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf2P23906 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irf2P23906 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf2P23906 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf2P23906 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irf2P23906 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms