Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bmp4P21275 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bmp4P21275 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bmp4P21275 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bmp4P21275 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bmp4P21275 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bmp4P21275 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bmp4P21275 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bmp4P21275 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bmp4P21275 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bmp4P21275 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bmp4P21275 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bmp4P21275 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bmp4P21275 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bmp4P21275 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bmp4P21275 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bmp4P21275 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bmp4P21275 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bmp4P21275 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bmp4P21275 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bmp4P21275 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bmp4P21275 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Bmp4P21275 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bmp4P21275 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bmp4P21275 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bmp4P21275 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bmp4P21275 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bmp4P21275 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bmp4P21275 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bmp4P21275 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bmp4P21275 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bmp4P21275 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bmp4P21275 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bmp4P21275 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Bmp4P21275 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bmp4P21275 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bmp4P21275 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bmp4P21275 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Bmp4P21275 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bmp4P21275 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bmp4P21275 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bmp4P21275 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bmp4P21275 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bmp4P21275 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bmp4P21275 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bmp4P21275 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bmp4P21275 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bmp4P21275 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bmp4P21275 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bmp4P21275 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bmp4P21275 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bmp4P21275 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bmp4P21275 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bmp4P21275 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bmp4P21275 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bmp4P21275 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bmp4P21275 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bmp4P21275 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bmp4P21275 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bmp4P21275 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Bmp4P21275 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bmp4P21275 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bmp4P21275 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bmp4P21275 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bmp4P21275 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bmp4P21275 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bmp4P21275 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bmp4P21275 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bmp4P21275 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bmp4P21275 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bmp4P21275 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bmp4P21275 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bmp4P21275 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bmp4P21275 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bmp4P21275 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bmp4P21275 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bmp4P21275 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bmp4P21275 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bmp4P21275 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bmp4P21275 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bmp4P21275 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bmp4P21275 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bmp4P21275 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Bmp4P21275 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bmp4P21275 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bmp4P21275 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bmp4P21275 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Bmp4P21275 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bmp4P21275 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bmp4P21275 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bmp4P21275 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bmp4P21275 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bmp4P21275 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bmp4P21275 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bmp4P21275 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bmp4P21275 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bmp4P21275 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bmp4P21275 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bmp4P21275 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bmp4P21275 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms