Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SptbP15508 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SptbP15508 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SptbP15508 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SptbP15508 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SptbP15508 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SptbP15508 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SptbP15508 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SptbP15508 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SptbP15508 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SptbP15508 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SptbP15508 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SptbP15508 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SptbP15508 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SptbP15508 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SptbP15508 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SptbP15508 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SptbP15508 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SptbP15508 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SptbP15508 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SptbP15508 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SptbP15508 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SptbP15508 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SptbP15508 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SptbP15508 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SptbP15508 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SptbP15508 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SptbP15508 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SptbP15508 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SptbP15508 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SptbP15508 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SptbP15508 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SptbP15508 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SptbP15508 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SptbP15508 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SptbP15508 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SptbP15508 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SptbP15508 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SptbP15508 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SptbP15508 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SptbP15508 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SptbP15508 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SptbP15508 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SptbP15508 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SptbP15508 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SptbP15508 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SptbP15508 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SptbP15508 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SptbP15508 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SptbP15508 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SptbP15508 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SptbP15508 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SptbP15508 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SptbP15508 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SptbP15508 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SptbP15508 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SptbP15508 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SptbP15508 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SptbP15508 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SptbP15508 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SptbP15508 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SptbP15508 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SptbP15508 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SptbP15508 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SptbP15508 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SptbP15508 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SptbP15508 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SptbP15508 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SptbP15508 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SptbP15508 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SptbP15508 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SptbP15508 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SptbP15508 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SptbP15508 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SptbP15508 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SptbP15508 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SptbP15508 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SptbP15508 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SptbP15508 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SptbP15508 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SptbP15508 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SptbP15508 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SptbP15508 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SptbP15508 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SptbP15508 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SptbP15508 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SptbP15508 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SptbP15508 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SptbP15508 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SptbP15508 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SptbP15508 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SptbP15508 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SptbP15508 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SptbP15508 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SptbP15508 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SptbP15508 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SptbP15508 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SptbP15508 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SptbP15508 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SptbP15508 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms