Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
TOP2AP11388 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
TOP2AP11388 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
TOP2AP11388 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
TOP2AP11388 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
TOP2AP11388 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
TOP2AP11388 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
TOP2AP11388 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
TOP2AP11388 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
TOP2AP11388 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
TOP2AP11388 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
TOP2AP11388 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
TOP2AP11388 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC47.28■■■■■ 5.16
TOP2AP11388 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
TOP2AP11388 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
TOP2AP11388 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
TOP2AP11388 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.16
TOP2AP11388 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
TOP2AP11388 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC47.24■■■■■ 5.15
TOP2AP11388 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
TOP2AP11388 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
TOP2AP11388 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC47.22■■■■■ 5.15
TOP2AP11388 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
TOP2AP11388 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
TOP2AP11388 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
TOP2AP11388 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
TOP2AP11388 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
TOP2AP11388 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC47.18■■■■■ 5.14
TOP2AP11388 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
TOP2AP11388 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC47.18■■■■■ 5.14
TOP2AP11388 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC47.18■■■■■ 5.14
TOP2AP11388 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC47.18■■■■■ 5.14
TOP2AP11388 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC47.17■■■■■ 5.14
TOP2AP11388 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
TOP2AP11388 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC47.16■■■■■ 5.14
TOP2AP11388 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
TOP2AP11388 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.14
TOP2AP11388 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.13
TOP2AP11388 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC47.12■■■■■ 5.13
TOP2AP11388 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
TOP2AP11388 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
TOP2AP11388 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC47.1■■■■■ 5.13
TOP2AP11388 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC47.09■■■■■ 5.13
TOP2AP11388 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
TOP2AP11388 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC47.09■■■■■ 5.13
TOP2AP11388 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC47.07■■■■■ 5.13
TOP2AP11388 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.06■■■■■ 5.12
TOP2AP11388 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC47.05■■■■■ 5.12
TOP2AP11388 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
TOP2AP11388 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
TOP2AP11388 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
TOP2AP11388 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC47.05■■■■■ 5.12
TOP2AP11388 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC47.01■■■■■ 5.12
TOP2AP11388 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
TOP2AP11388 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC47■■■■■ 5.11
TOP2AP11388 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47■■■■■ 5.11
TOP2AP11388 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
TOP2AP11388 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.95■■■■■ 5.11
TOP2AP11388 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
TOP2AP11388 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC46.93■■■■■ 5.1
TOP2AP11388 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
TOP2AP11388 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
TOP2AP11388 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
TOP2AP11388 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC46.92■■■■■ 5.1
TOP2AP11388 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
TOP2AP11388 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
TOP2AP11388 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.91■■■■■ 5.1
TOP2AP11388 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC46.9■■■■■ 5.1
TOP2AP11388 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
TOP2AP11388 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC46.88■■■■■ 5.1
TOP2AP11388 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
TOP2AP11388 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC46.88■■■■■ 5.1
TOP2AP11388 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
TOP2AP11388 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.86■■■■■ 5.09
TOP2AP11388 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
TOP2AP11388 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
TOP2AP11388 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
TOP2AP11388 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
TOP2AP11388 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
TOP2AP11388 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
TOP2AP11388 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
TOP2AP11388 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
TOP2AP11388 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
TOP2AP11388 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
TOP2AP11388 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
TOP2AP11388 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
TOP2AP11388 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
TOP2AP11388 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC46.82■■■■■ 5.09
TOP2AP11388 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
TOP2AP11388 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
TOP2AP11388 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
TOP2AP11388 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
TOP2AP11388 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
TOP2AP11388 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.8■■■■■ 5.08
TOP2AP11388 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC46.77■■■■■ 5.08
TOP2AP11388 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
TOP2AP11388 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC46.76■■■■■ 5.08
TOP2AP11388 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
TOP2AP11388 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC46.72■■■■■ 5.07
TOP2AP11388 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms