Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt1P04104 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt1P04104 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt1P04104 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt1P04104 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt1P04104 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt1P04104 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt1P04104 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt1P04104 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt1P04104 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt1P04104 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt1P04104 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt1P04104 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt1P04104 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt1P04104 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt1P04104 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt1P04104 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt1P04104 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt1P04104 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt1P04104 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt1P04104 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt1P04104 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt1P04104 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt1P04104 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt1P04104 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt1P04104 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt1P04104 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt1P04104 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt1P04104 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt1P04104 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt1P04104 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt1P04104 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt1P04104 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt1P04104 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt1P04104 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt1P04104 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt1P04104 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt1P04104 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt1P04104 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt1P04104 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt1P04104 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt1P04104 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt1P04104 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt1P04104 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt1P04104 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt1P04104 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt1P04104 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt1P04104 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt1P04104 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt1P04104 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt1P04104 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt1P04104 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt1P04104 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt1P04104 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt1P04104 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms