Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lamc1P02468 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Lamc1P02468 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Lamc1P02468 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Lamc1P02468 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lamc1P02468 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Lamc1P02468 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
Lamc1P02468 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Lamc1P02468 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Lamc1P02468 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Lamc1P02468 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Lamc1P02468 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Lamc1P02468 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Lamc1P02468 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Lamc1P02468 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Lamc1P02468 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Lamc1P02468 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Lamc1P02468 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Lamc1P02468 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Lamc1P02468 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Lamc1P02468 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Lamc1P02468 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Lamc1P02468 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Lamc1P02468 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Lamc1P02468 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Lamc1P02468 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Lamc1P02468 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Lamc1P02468 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Lamc1P02468 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Lamc1P02468 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Lamc1P02468 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Lamc1P02468 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Lamc1P02468 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Lamc1P02468 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Lamc1P02468 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Lamc1P02468 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Lamc1P02468 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Lamc1P02468 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Lamc1P02468 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Lamc1P02468 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Lamc1P02468 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Lamc1P02468 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Lamc1P02468 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Lamc1P02468 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Lamc1P02468 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Lamc1P02468 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Lamc1P02468 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Lamc1P02468 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Lamc1P02468 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Lamc1P02468 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Lamc1P02468 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Lamc1P02468 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Lamc1P02468 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Lamc1P02468 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Lamc1P02468 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Lamc1P02468 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Lamc1P02468 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Lamc1P02468 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Lamc1P02468 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Lamc1P02468 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Lamc1P02468 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Lamc1P02468 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Lamc1P02468 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Lamc1P02468 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Lamc1P02468 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Lamc1P02468 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Lamc1P02468 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Lamc1P02468 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Lamc1P02468 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Lamc1P02468 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Lamc1P02468 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Lamc1P02468 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Lamc1P02468 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Lamc1P02468 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Lamc1P02468 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Lamc1P02468 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Lamc1P02468 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Lamc1P02468 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Lamc1P02468 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lamc1P02468 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lamc1P02468 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lamc1P02468 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Lamc1P02468 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Lamc1P02468 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Lamc1P02468 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Lamc1P02468 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Lamc1P02468 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lamc1P02468 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Lamc1P02468 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Lamc1P02468 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Lamc1P02468 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Lamc1P02468 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Lamc1P02468 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lamc1P02468 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lamc1P02468 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Lamc1P02468 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Lamc1P02468 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Lamc1P02468 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Lamc1P02468 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Lamc1P02468 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms