Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01656 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01656 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01656 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01656 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01656 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01656 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01656 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P01656 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01656 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01656 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
P01656 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01656 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01656 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01656 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01656 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01656 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01656 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01656 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01656 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01656 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01656 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01656 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01656 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01656 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01656 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
P01656 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01656 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01656 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01656 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01656 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01656 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01656 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01656 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01656 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01656 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01656 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01656 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01656 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01656 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01656 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01656 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01656 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01656 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01656 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01656 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01656 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01656 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01656 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01656 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01656 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
P01656 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
P01656 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
P01656 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
P01656 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01656 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01656 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01656 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01656 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01656 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01656 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01656 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01656 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01656 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01656 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01656 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01656 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01656 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
P01656 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
P01656 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01656 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01656 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01656 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01656 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01656 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01656 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01656 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01656 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01656 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01656 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01656 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01656 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01656 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01656 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
P01656 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01656 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01656 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01656 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01656 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
P01656 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01656 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01656 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01656 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01656 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01656 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01656 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01656 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01656 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01656 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01656 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms