Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01654 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01654 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01654 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01654 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01654 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01654 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01654 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P01654 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01654 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01654 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
P01654 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01654 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01654 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01654 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01654 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01654 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01654 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01654 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01654 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01654 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01654 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01654 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01654 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01654 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01654 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
P01654 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01654 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01654 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01654 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01654 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01654 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01654 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01654 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01654 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01654 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01654 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01654 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01654 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01654 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01654 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01654 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01654 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01654 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01654 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01654 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01654 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01654 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01654 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01654 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01654 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
P01654 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
P01654 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
P01654 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
P01654 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01654 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01654 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01654 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01654 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01654 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01654 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01654 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01654 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01654 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01654 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01654 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01654 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01654 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
P01654 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
P01654 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01654 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01654 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01654 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01654 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01654 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01654 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01654 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01654 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01654 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01654 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01654 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01654 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01654 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01654 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
P01654 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01654 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01654 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01654 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01654 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
P01654 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01654 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01654 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01654 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01654 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01654 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01654 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01654 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01654 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01654 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01654 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms