Protein–RNA interactions for Protein: O75956

CDK2AP2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP2O75956 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2AP2O75956 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK2AP2O75956 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK2AP2O75956 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK2AP2O75956 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK2AP2O75956 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms