Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNKO75909 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNKO75909 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNKO75909 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNKO75909 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNKO75909 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNKO75909 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNKO75909 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNKO75909 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNKO75909 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNKO75909 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNKO75909 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNKO75909 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNKO75909 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNKO75909 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNKO75909 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNKO75909 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNKO75909 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNKO75909 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNKO75909 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNKO75909 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNKO75909 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNKO75909 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNKO75909 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNKO75909 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNKO75909 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNKO75909 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNKO75909 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNKO75909 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNKO75909 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNKO75909 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNKO75909 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNKO75909 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNKO75909 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNKO75909 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNKO75909 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNKO75909 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNKO75909 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNKO75909 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNKO75909 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNKO75909 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNKO75909 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNKO75909 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNKO75909 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNKO75909 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNKO75909 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNKO75909 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNKO75909 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNKO75909 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNKO75909 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNKO75909 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNKO75909 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNKO75909 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNKO75909 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNKO75909 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNKO75909 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNKO75909 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNKO75909 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNKO75909 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNKO75909 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNKO75909 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNKO75909 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNKO75909 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNKO75909 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNKO75909 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNKO75909 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNKO75909 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNKO75909 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNKO75909 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNKO75909 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNKO75909 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNKO75909 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNKO75909 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNKO75909 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNKO75909 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNKO75909 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNKO75909 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNKO75909 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNKO75909 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNKO75909 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNKO75909 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNKO75909 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNKO75909 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNKO75909 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNKO75909 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNKO75909 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNKO75909 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNKO75909 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNKO75909 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNKO75909 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNKO75909 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNKO75909 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNKO75909 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNKO75909 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNKO75909 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNKO75909 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNKO75909 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNKO75909 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNKO75909 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNKO75909 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms