Protein–RNA interactions for Protein: O54824

Il16, Pro-interleukin-16, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il16O54824 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
Il16O54824 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Il16O54824 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Il16O54824 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Il16O54824 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Il16O54824 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Il16O54824 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Il16O54824 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Il16O54824 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Il16O54824 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Il16O54824 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Il16O54824 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Il16O54824 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Il16O54824 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Il16O54824 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Il16O54824 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Il16O54824 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Il16O54824 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Il16O54824 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Il16O54824 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Il16O54824 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Il16O54824 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Il16O54824 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Il16O54824 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Il16O54824 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Il16O54824 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Il16O54824 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Il16O54824 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Il16O54824 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Il16O54824 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Il16O54824 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Il16O54824 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Il16O54824 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Il16O54824 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Il16O54824 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Il16O54824 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Il16O54824 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Il16O54824 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Il16O54824 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Il16O54824 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Il16O54824 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Il16O54824 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Il16O54824 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Il16O54824 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Il16O54824 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Il16O54824 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Il16O54824 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Il16O54824 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Il16O54824 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Il16O54824 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Il16O54824 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Il16O54824 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Il16O54824 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Il16O54824 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Il16O54824 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Il16O54824 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Il16O54824 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Il16O54824 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Il16O54824 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Il16O54824 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Il16O54824 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Il16O54824 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Il16O54824 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Il16O54824 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Il16O54824 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Il16O54824 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Il16O54824 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Il16O54824 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Il16O54824 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Il16O54824 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Il16O54824 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Il16O54824 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Il16O54824 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Il16O54824 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Il16O54824 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Il16O54824 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Il16O54824 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Il16O54824 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Il16O54824 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Il16O54824 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Il16O54824 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Il16O54824 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Il16O54824 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Il16O54824 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Il16O54824 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Il16O54824 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Il16O54824 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Il16O54824 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Il16O54824 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Il16O54824 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Il16O54824 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Il16O54824 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Il16O54824 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Il16O54824 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Il16O54824 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Il16O54824 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Il16O54824 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Il16O54824 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Il16O54824 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Il16O54824 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms