Protein–RNA interactions for Protein: O08934

Uncx, Homeobox protein unc-4 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UncxO08934 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UncxO08934 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UncxO08934 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UncxO08934 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UncxO08934 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UncxO08934 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UncxO08934 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
UncxO08934 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UncxO08934 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UncxO08934 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
UncxO08934 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UncxO08934 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UncxO08934 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UncxO08934 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UncxO08934 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UncxO08934 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UncxO08934 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UncxO08934 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UncxO08934 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UncxO08934 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UncxO08934 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UncxO08934 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UncxO08934 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UncxO08934 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UncxO08934 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UncxO08934 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UncxO08934 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UncxO08934 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UncxO08934 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UncxO08934 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UncxO08934 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UncxO08934 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UncxO08934 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UncxO08934 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UncxO08934 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UncxO08934 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UncxO08934 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UncxO08934 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UncxO08934 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UncxO08934 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UncxO08934 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UncxO08934 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UncxO08934 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UncxO08934 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UncxO08934 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UncxO08934 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UncxO08934 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UncxO08934 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UncxO08934 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UncxO08934 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UncxO08934 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UncxO08934 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UncxO08934 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UncxO08934 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
UncxO08934 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
UncxO08934 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UncxO08934 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UncxO08934 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UncxO08934 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UncxO08934 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UncxO08934 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UncxO08934 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
UncxO08934 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UncxO08934 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UncxO08934 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UncxO08934 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UncxO08934 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UncxO08934 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UncxO08934 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UncxO08934 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UncxO08934 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UncxO08934 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UncxO08934 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UncxO08934 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UncxO08934 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UncxO08934 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UncxO08934 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UncxO08934 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UncxO08934 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
UncxO08934 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UncxO08934 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UncxO08934 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UncxO08934 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UncxO08934 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UncxO08934 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
UncxO08934 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UncxO08934 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UncxO08934 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UncxO08934 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UncxO08934 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UncxO08934 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UncxO08934 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UncxO08934 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
UncxO08934 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UncxO08934 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UncxO08934 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UncxO08934 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UncxO08934 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UncxO08934 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UncxO08934 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150 ms