Protein–RNA interactions for Protein: O08791

Ebf3, Transcription factor COE3, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf3O08791 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ebf3O08791 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ebf3O08791 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ebf3O08791 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ebf3O08791 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ebf3O08791 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ebf3O08791 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ebf3O08791 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ebf3O08791 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ebf3O08791 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ebf3O08791 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ebf3O08791 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ebf3O08791 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ebf3O08791 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ebf3O08791 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ebf3O08791 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ebf3O08791 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ebf3O08791 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ebf3O08791 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ebf3O08791 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ebf3O08791 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ebf3O08791 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ebf3O08791 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ebf3O08791 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ebf3O08791 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ebf3O08791 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ebf3O08791 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ebf3O08791 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ebf3O08791 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ebf3O08791 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ebf3O08791 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ebf3O08791 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ebf3O08791 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ebf3O08791 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ebf3O08791 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ebf3O08791 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ebf3O08791 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ebf3O08791 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ebf3O08791 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ebf3O08791 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ebf3O08791 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ebf3O08791 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ebf3O08791 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ebf3O08791 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ebf3O08791 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ebf3O08791 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ebf3O08791 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ebf3O08791 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ebf3O08791 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ebf3O08791 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ebf3O08791 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ebf3O08791 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ebf3O08791 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ebf3O08791 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ebf3O08791 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ebf3O08791 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ebf3O08791 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ebf3O08791 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ebf3O08791 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ebf3O08791 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ebf3O08791 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ebf3O08791 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ebf3O08791 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ebf3O08791 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ebf3O08791 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ebf3O08791 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ebf3O08791 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ebf3O08791 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ebf3O08791 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ebf3O08791 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ebf3O08791 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ebf3O08791 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ebf3O08791 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ebf3O08791 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ebf3O08791 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ebf3O08791 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ebf3O08791 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ebf3O08791 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ebf3O08791 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ebf3O08791 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ebf3O08791 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ebf3O08791 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ebf3O08791 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ebf3O08791 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ebf3O08791 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ebf3O08791 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ebf3O08791 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ebf3O08791 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ebf3O08791 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ebf3O08791 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ebf3O08791 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ebf3O08791 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ebf3O08791 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ebf3O08791 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ebf3O08791 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ebf3O08791 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ebf3O08791 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ebf3O08791 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ebf3O08791 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ebf3O08791 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms