Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MttpO08601 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MttpO08601 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MttpO08601 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MttpO08601 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MttpO08601 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MttpO08601 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MttpO08601 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MttpO08601 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MttpO08601 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MttpO08601 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MttpO08601 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MttpO08601 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MttpO08601 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MttpO08601 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MttpO08601 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MttpO08601 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MttpO08601 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MttpO08601 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MttpO08601 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MttpO08601 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MttpO08601 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MttpO08601 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MttpO08601 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MttpO08601 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MttpO08601 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MttpO08601 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MttpO08601 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MttpO08601 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MttpO08601 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MttpO08601 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MttpO08601 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MttpO08601 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MttpO08601 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MttpO08601 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MttpO08601 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MttpO08601 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MttpO08601 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MttpO08601 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MttpO08601 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MttpO08601 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MttpO08601 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MttpO08601 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MttpO08601 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MttpO08601 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MttpO08601 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MttpO08601 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MttpO08601 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MttpO08601 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MttpO08601 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MttpO08601 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MttpO08601 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MttpO08601 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MttpO08601 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MttpO08601 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MttpO08601 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MttpO08601 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MttpO08601 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MttpO08601 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MttpO08601 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MttpO08601 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MttpO08601 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MttpO08601 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MttpO08601 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MttpO08601 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MttpO08601 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MttpO08601 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MttpO08601 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MttpO08601 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MttpO08601 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MttpO08601 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MttpO08601 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MttpO08601 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MttpO08601 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MttpO08601 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MttpO08601 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MttpO08601 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MttpO08601 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MttpO08601 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MttpO08601 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MttpO08601 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MttpO08601 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MttpO08601 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MttpO08601 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MttpO08601 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MttpO08601 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MttpO08601 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MttpO08601 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MttpO08601 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MttpO08601 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MttpO08601 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MttpO08601 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MttpO08601 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MttpO08601 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MttpO08601 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MttpO08601 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MttpO08601 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MttpO08601 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MttpO08601 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MttpO08601 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms