Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r80L7N1Z3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r80L7N1Z3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r80L7N1Z3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r80L7N1Z3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r80L7N1Z3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r80L7N1Z3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r80L7N1Z3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r80L7N1Z3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r80L7N1Z3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r80L7N1Z3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r80L7N1Z3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r80L7N1Z3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r80L7N1Z3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r80L7N1Z3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r80L7N1Z3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r80L7N1Z3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r80L7N1Z3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r80L7N1Z3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r80L7N1Z3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r80L7N1Z3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r80L7N1Z3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r80L7N1Z3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r80L7N1Z3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r80L7N1Z3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r80L7N1Z3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r80L7N1Z3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r80L7N1Z3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r80L7N1Z3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r80L7N1Z3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r80L7N1Z3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r80L7N1Z3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r80L7N1Z3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r80L7N1Z3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r80L7N1Z3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r80L7N1Z3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r80L7N1Z3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r80L7N1Z3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r80L7N1Z3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r80L7N1Z3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vmn1r80L7N1Z3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r80L7N1Z3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r80L7N1Z3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r80L7N1Z3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r80L7N1Z3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r80L7N1Z3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r80L7N1Z3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r80L7N1Z3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r80L7N1Z3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r80L7N1Z3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r80L7N1Z3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r80L7N1Z3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r80L7N1Z3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r80L7N1Z3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r80L7N1Z3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r80L7N1Z3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r80L7N1Z3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r80L7N1Z3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r80L7N1Z3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r80L7N1Z3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r80L7N1Z3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r80L7N1Z3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r80L7N1Z3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r80L7N1Z3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r80L7N1Z3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r80L7N1Z3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r80L7N1Z3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r80L7N1Z3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r80L7N1Z3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r80L7N1Z3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r80L7N1Z3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r80L7N1Z3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r80L7N1Z3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r80L7N1Z3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r80L7N1Z3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r80L7N1Z3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r80L7N1Z3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r80L7N1Z3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r80L7N1Z3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r80L7N1Z3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r80L7N1Z3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r80L7N1Z3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r80L7N1Z3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r80L7N1Z3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r80L7N1Z3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r80L7N1Z3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn1r80L7N1Z3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r80L7N1Z3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r80L7N1Z3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r80L7N1Z3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r80L7N1Z3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r80L7N1Z3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r80L7N1Z3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r80L7N1Z3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r80L7N1Z3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms