Protein–RNA interactions for Protein: J3QNZ6

Gm21874, Predicted gene, 21874, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21874J3QNZ6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21874J3QNZ6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21874J3QNZ6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21874J3QNZ6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21874J3QNZ6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21874J3QNZ6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21874J3QNZ6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21874J3QNZ6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21874J3QNZ6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21874J3QNZ6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21874J3QNZ6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21874J3QNZ6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21874J3QNZ6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21874J3QNZ6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21874J3QNZ6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21874J3QNZ6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21874J3QNZ6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21874J3QNZ6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21874J3QNZ6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21874J3QNZ6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21874J3QNZ6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21874J3QNZ6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21874J3QNZ6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21874J3QNZ6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21874J3QNZ6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21874J3QNZ6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21874J3QNZ6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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